36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2444 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2444  putative sporulation protein YyaC  100 
 
 
176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2154  putative sporulation protein YyaC  98.3 
 
 
176 aa  346  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0442  hypothetical protein  45.18 
 
 
170 aa  141  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000187912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5330  hypothetical protein  46.63 
 
 
198 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.036845  hitchhiker  0.0000101439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5605  hypothetical protein  46.63 
 
 
198 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0771462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5271  hypothetical protein  48.1 
 
 
198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5331  hypothetical protein  46.39 
 
 
198 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5588  hypothetical protein  46.39 
 
 
198 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000409066 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5159  hypothetical protein  46.39 
 
 
198 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5728  hypothetical protein  46.39 
 
 
198 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5175  hypothetical protein  46.39 
 
 
198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5629  hypothetical protein  45.12 
 
 
198 aa  134  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5665  hypothetical protein  46.39 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4018  hypothetical protein  44.08 
 
 
196 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3422  sporulation protein YyaC  42.57 
 
 
208 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.69538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2508  hypothetical protein  38.6 
 
 
209 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0264169 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3551  sporulation protein YyaC  40.26 
 
 
207 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4360  sporulation protein YyaC  40.56 
 
 
199 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23460  putative sporulation protein YyaC  39.46 
 
 
193 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2141  sporulation protein YyaC  38.22 
 
 
203 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0917856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4946  sporulation protein YyaC  40.43 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00489087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3314  hypothetical protein  40 
 
 
201 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1197  hypothetical protein  41.94 
 
 
178 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00258545  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2937  sporulation protein YyaC  38.03 
 
 
183 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2165  hypothetical protein  40.27 
 
 
197 aa  103  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2397  hypothetical protein  37.27 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0293398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2563  YyaC  35.97 
 
 
203 aa  95.9  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2222  hypothetical protein  30.41 
 
 
211 aa  95.9  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0050  sporulation protein YyaC  36.14 
 
 
197 aa  93.6  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3360  sporulation protein YyaC  31.82 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2922  sporulation protein YyaC  32.95 
 
 
199 aa  92.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2663  putative sporulation protein YyaC  30.46 
 
 
196 aa  87.4  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3070  hypothetical protein  33.14 
 
 
196 aa  87  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000715202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2985  putative sporulation protein YyaC  30.46 
 
 
196 aa  87  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0804637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0915  sporulation protein YyaC  34.78 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0823  hypothetical protein  33.02 
 
 
198 aa  64.3  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>