35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1401 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1401  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1213  hypothetical protein  95.83 
 
 		 192 aa  336  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.027666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3693  uncharacterized metal-binding protein  33.5 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.9304  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2418  hypothetical protein  33.5 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2913  hypothetical protein  31.31 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000534852  hitchhiker  0.00865709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0532  hypothetical protein  33.51 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2031  hypothetical protein  35.83 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.530853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1492  hypothetical protein  40.82 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3806  hypothetical protein  29.27 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.157266 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2226  hypothetical protein  32.85 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5031  hypothetical protein  42.31 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.932275  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18141  hypothetical protein  33.14 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0228  uncharacterized metal-binding protein-like protein  24.62 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0463  hypothetical protein  23.91 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29371  hypothetical protein  39.42 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5345  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000001424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1742  uncharacterized metal-binding protein-like protein  26.53 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.427976  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5079  hypothetical protein  31.55 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000671966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5467  hypothetical protein  31.55 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5319  hypothetical protein  31.55 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12161e-42 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5351  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000175356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5608  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000806072  hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4911  hypothetical protein  30.95 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.64977e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4926  hypothetical protein  39.09 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000688906  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5402  hypothetical protein  32.14 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000247571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4624  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.59 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000326452  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2587  hypothetical protein  27.53 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.351509  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2127  hypothetical protein  26.06 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3764  hypothetical protein  35.09 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0645  hypothetical protein  31.68 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1187  hypothetical protein  29.17 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0248413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1290  hypothetical protein  30.81 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000899628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3088  Protein of unknown function DUF2227, metal-binding protein  27.27 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5021  hypothetical protein  34.44 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000008076  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1337  hypothetical protein  32.11 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.240333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>