15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1013 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1013  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  191  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.318578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3448  hypothetical protein  39.78 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3249  hypothetical protein  34.83 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.645983  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3222  hypothetical protein  34.83 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00578917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3159  hypothetical protein  34.83 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0176987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3504  hypothetical protein  34.83 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3155  hypothetical protein  34.83 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000573133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3476  hypothetical protein  34.83 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0203743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3464  hypothetical protein  34.83 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1800  hypothetical protein  37.08 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3455  hypothetical protein  36.67 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000379488  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1758  hypothetical protein  38.55 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.380189  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31740  hypothetical protein  33.72 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0302  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2564  hypothetical protein  40.74 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0537869  normal  0.0608845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>