23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0890 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0890  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  100 
 
 		 477 aa  950    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2647  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  65.64 
 
 		 489 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1053  Ethanolamine utilisation EutA  54.17 
 
 		 475 aa  481  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0083  Ethanolamine utilisation EutA  45.21 
 
 		 476 aa  436  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4859  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  39.96 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1297  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  41.3 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4035  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  35.76 
 
 		 478 aa  296  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1239  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  35.22 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2652  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  36.11 
 
 		 467 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2604  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  36.11 
 
 		 467 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2693  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  35.9 
 
 		 467 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2826  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  35.9 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2597  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  35.03 
 
 		 467 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3672  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  34.83 
 
 		 467 aa  269  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2728  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  35.06 
 
 		 467 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1226  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  35.06 
 
 		 467 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2579  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  35.06 
 
 		 467 aa  269  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02304  hypothetical protein  35.03 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1219  Ethanolamine utilisation EutA  35.03 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2719  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  35.7 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.636685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02342  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  35.03 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2817  reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase  34.62 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2076  Ppx/GppA phosphatase  23.81 
 
 		 294 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>