15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01860 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM01860  conserved hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  987    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31835  predicted protein  41.86 
 
 
467 aa  331  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29800  predicted protein  38.93 
 
 
531 aa  296  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01427  DUF895 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04110)  37.66 
 
 
508 aa  282  9e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371753 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08127  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17480)  34.6 
 
 
482 aa  239  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.642015 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10332  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 
461 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.93778 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02699  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 
467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0231464  normal  0.612902 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06949  conserved hypothetical protein  28.6 
 
 
523 aa  169  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00230  expressed protein  28.54 
 
 
496 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00399187  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02562  DUF895 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G15000)  29.46 
 
 
451 aa  160  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.666274 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02680  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 
478 aa  154  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08124  conserved hypothetical protein  26.84 
 
 
463 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.906972  normal  0.172966 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02783  conserved hypothetical protein  25 
 
 
464 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00850  membrane protein, putative  27.08 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04600  expressed protein  24.23 
 
 
495 aa  94.4  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.571814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>