14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH02600 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH02600  conserved hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  860    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.134539  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05438  TPR repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G13600)  30.59 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236413  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45844  predicted protein  24.94 
 
 
560 aa  80.9  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29879  predicted protein  27.88 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.130905  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06829  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12710)  34.68 
 
 
710 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.672401  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86132  predicted protein  33.33 
 
 
258 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.279503  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01930  conserved hypothetical protein  30 
 
 
625 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10987  conserved hypothetical protein  28.17 
 
 
217 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1963  hypothetical protein  30.32 
 
 
554 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25206  predicted protein  28.93 
 
 
477 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00400677  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07687  mitochondrial outer membrane translocase receptor (TOM70), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01660)  30.85 
 
 
636 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.146912 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04110  ER organization and biogenesis-related protein, putative  33.33 
 
 
836 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0969771  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04192  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05900)  31.58 
 
 
634 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107548  normal  0.45593 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34214  predicted protein  29.09 
 
 
131 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.623436  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>