23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00880 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00880  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  642    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2103  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  34.89 
 
 		 277 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.446966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0050  hypothetical protein  32.3 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0286  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  26.67 
 
 		 215 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0108  peptidylprolyl isomerase  31.06 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000088366  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0192  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  27.56 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  50.82 
 
 		 2074 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2251  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.1 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0762925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3841  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.27 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2217  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  28.21 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000168304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0537  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  30.83 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  hitchhiker  0.000000013883 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12254  predicted protein  30.53 
 
 		 112 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0384  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.31 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5467  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  28.68 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.201374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4021  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.27 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0470  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.2 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3926  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.43 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3683  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.43 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.154602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0270  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.43 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.355026  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3462  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FklB  27.91 
 
 		 213 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.164009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0308  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.45 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.254964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  28.42 
 
 		 3861 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0774  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.36 
 
 		 238 aa  42.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.14005e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>