18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0679 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0679  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  275  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2068  hypothetical protein  75.19 
 
 
133 aa  199  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5038  hypothetical protein  71 
 
 
136 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469279  normal  0.373652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4098  hypothetical protein  53.73 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063124  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0515  hypothetical protein  54.14 
 
 
130 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0954  hypothetical protein  54.14 
 
 
130 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0994  hypothetical protein  54.14 
 
 
130 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.536746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0085  hypothetical protein  56.3 
 
 
185 aa  141  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1574  hypothetical protein  64.65 
 
 
213 aa  140  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141719  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0108  hypothetical protein  64.65 
 
 
185 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887063  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0076  hypothetical protein  51.13 
 
 
133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1514  hypothetical protein  64.89 
 
 
157 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1233  hypothetical protein  64.89 
 
 
115 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0089  putative lipoprotein  64.89 
 
 
157 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0075  hypothetical protein  64.89 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154671  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2406  hypothetical protein  57.89 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0854  hypothetical protein  51.13 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141696  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0866  hypothetical protein  50.38 
 
 
133 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>