10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5460 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2202  hypothetical protein  67.98 
 
 
951 aa  1286    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.156396  normal  0.559459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5460  heat-labile enterotoxin A chain  100 
 
 
965 aa  1970    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0462403  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2168  hypothetical protein  38.47 
 
 
1117 aa  502  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1851  hypothetical protein  34.8 
 
 
1238 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296057  normal  0.0150082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0732  hypothetical protein  35.46 
 
 
934 aa  343  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1766  hypothetical protein  37.23 
 
 
509 aa  291  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1767  hypothetical protein  40.91 
 
 
222 aa  56.6  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.579875  hitchhiker  0.000358302 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0020  heat-labile enterotoxin A  36.17 
 
 
269 aa  51.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.969992  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0512  cholera enterotoxin, A subunit  36.17 
 
 
258 aa  47.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1060  cholera enterotoxin, A subunit  36.17 
 
 
258 aa  47.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>