28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05960  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.534125  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3308  hypothetical protein  50.31 
 
 
166 aa  151  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3729  hypothetical protein  49.4 
 
 
169 aa  137  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0248179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6190  hypothetical protein  36.69 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3736  hypothetical protein  41.61 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3938  hypothetical protein  40.36 
 
 
192 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.93013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4232  hypothetical protein  45.6 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2814  hypothetical protein  39.63 
 
 
161 aa  111  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0469  hypothetical protein  36.81 
 
 
164 aa  110  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0571  hypothetical protein  39.39 
 
 
163 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4404  hypothetical protein  43.94 
 
 
164 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4259  hypothetical protein  43.51 
 
 
163 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9030  hypothetical protein  40.15 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779481  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0201  hypothetical protein  41.1 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4504  hypothetical protein  42.22 
 
 
164 aa  94.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1143  hypothetical protein  39.52 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4464  hypothetical protein  33.6 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1962  fibronectin-binding protein  26.17 
 
 
213 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1927  fibronectin-binding protein, putative  26.17 
 
 
213 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1442  fibronectin-binding family protein  25.47 
 
 
212 aa  44.3  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1884  fibronectin-binding protein  26.17 
 
 
213 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1700  fibronectin-binding family protein  26.17 
 
 
213 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1840  fibronectin-binding protein  26.17 
 
 
213 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.147815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1705  fibronectin-binding protein  26.17 
 
 
213 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1845  fibronectin-binding protein  26.17 
 
 
213 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1661  fibronectin-binding protein  26.17 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00307165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1686  fibronectin-binding protein  25.23 
 
 
213 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.677891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3498  fibronectin-binding protein  25.23 
 
 
213 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>