13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3573 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3573  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  193  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4794  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  193  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0917  hypothetical protein  90.62 
 
 
65 aa  123  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3807  hypothetical protein  69.23 
 
 
65 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0772852  hitchhiker  0.00532281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4711  hypothetical protein  71.43 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414183  normal  0.011152 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5977  hypothetical protein  71.79 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.355962  normal  0.578827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5255  hypothetical protein  47.76 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5805  hypothetical protein  54.35 
 
 
69 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5920  hypothetical protein  54.29 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2933  hypothetical protein  55.26 
 
 
62 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0190325  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4249  hypothetical protein  54.55 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2829  hypothetical protein  47.37 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104908  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08280  hypothetical protein  51.02 
 
 
50 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.733392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>