29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4978 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4978  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15416  normal  0.695454 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4402  hypothetical protein  87.91 
 
 
91 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.986651  normal  0.162592 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5309  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0710314 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3389  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0699  hypothetical protein  95.24 
 
 
63 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4921  hypothetical protein  90.48 
 
 
63 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.304252  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3642  hypothetical protein  92.06 
 
 
63 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1818  hypothetical protein  77.78 
 
 
64 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2161  hypothetical protein  79.37 
 
 
64 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0801  hypothetical protein  79.37 
 
 
64 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426766  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0892  hypothetical protein  79.37 
 
 
64 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170694  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2023  hypothetical protein  49.21 
 
 
63 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285792 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3426  hypothetical protein  49.18 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.592964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1839  hypothetical protein  50.82 
 
 
79 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.548549  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5593  conserved hypothetical protein, transmembrane  45.9 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0267855  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6389  hypothetical protein  41.27 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418039  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1439  hypothetical protein  41.27 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6945  hypothetical protein  46.43 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00473369  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7053  hypothetical protein  39.68 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0699  hypothetical protein  45.16 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0845597  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2424  hypothetical protein  45.16 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1574  hypothetical protein  46.77 
 
 
62 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0480086  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1730  hypothetical protein  45.16 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1149  hypothetical protein  45.16 
 
 
62 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1223  hypothetical protein  45.16 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121352  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0765  hypothetical protein  45.16 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6466  hypothetical protein  44.07 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.586082 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5713  hypothetical protein  44.07 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.439977 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5880  hypothetical protein  28.79 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>