22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2318 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1706  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2318  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2357  hypothetical protein  94.55 
 
 
64 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2237  hypothetical protein  92.73 
 
 
64 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239815  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1246  hypothetical protein  87.27 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.657721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3300  hypothetical protein  85.96 
 
 
70 aa  91.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757795  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2341  hypothetical protein  96.72 
 
 
61 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0112446 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1920.1  hypothetical protein  77.27 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250607  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5660  hypothetical protein  83.61 
 
 
61 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.523505  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1197  putative lipoprotein  84.62 
 
 
54 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0319  hypothetical protein  84.62 
 
 
54 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0320023  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1189  putative lipoprotein  84.62 
 
 
54 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.502784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0831  hypothetical protein  84.62 
 
 
54 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1036  hypothetical protein  84.62 
 
 
54 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.217353  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2086  hypothetical protein  83.33 
 
 
62 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0958249 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4723  putative lipoprotein  78 
 
 
55 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0732932 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3646  lipoprotein  78 
 
 
55 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00829  lipoprotein  91.89 
 
 
55 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991871  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0959  hypothetical protein  81.97 
 
 
61 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2781  putative lipoprotein  64.44 
 
 
69 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0375  putative lipoprotein  60 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3583  putative lipoprotein  62.5 
 
 
55 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0218279  hitchhiker  0.00000158085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>