16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5619 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5619  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6350  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572502  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1356  hypothetical protein  89.11 
 
 		 101 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6473  hypothetical protein  89.11 
 
 		 101 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6062  hypothetical protein  90.82 
 
 		 100 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554987  normal  0.162691 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7017  hypothetical protein  88.12 
 
 		 101 aa  188  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5467  hypothetical protein  80 
 
 		 101 aa  170  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355825 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3132  hypothetical protein  59.41 
 
 		 99 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.748979  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3004  hypothetical protein  59.41 
 
 		 99 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1354  hypothetical protein  59.41 
 
 		 291 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199497  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5296  hypothetical protein  53.68 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0458646 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3982  hypothetical protein  52.13 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4385  hypothetical protein  52.13 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0888417  normal  0.672585 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5970  hypothetical protein  51.58 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4237  hypothetical protein  54.65 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1635  hypothetical protein  48.42 
 
 		 99 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>