19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5584 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5584  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6310  hypothetical protein  98.75 
 
 
80 aa  157  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.358429 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5497  hypothetical protein  93.75 
 
 
80 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0105181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1324  hypothetical protein  83.75 
 
 
97 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0429971  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6505  hypothetical protein  83.75 
 
 
97 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.569749  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6094  hypothetical protein  83.75 
 
 
97 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7036  hypothetical protein  77.5 
 
 
80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1395  hypothetical protein  50.72 
 
 
72 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6434  hypothetical protein  50.72 
 
 
72 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6024  hypothetical protein  50.72 
 
 
72 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0238074 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7010  hypothetical protein  49.28 
 
 
72 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0259822  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1999  hypothetical protein  44.59 
 
 
202 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5423  hypothetical protein  52.46 
 
 
72 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.11939 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1020  hypothetical protein  45.83 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366828  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1308  hypothetical protein  50.79 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3050  hypothetical protein  50.79 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3179  hypothetical protein  50.79 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4767  hypothetical protein  45.31 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900583  normal  0.605656 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6888  hypothetical protein  36.76 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>