16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5342 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5342  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3510  hypothetical protein  99.05 
 
 		 317 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.304087  normal  0.104334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2510  hypothetical protein  90.54 
 
 		 317 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3604  hypothetical protein  92.43 
 
 		 317 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3916  hypothetical protein  92.11 
 
 		 317 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1973  hypothetical protein  82.97 
 
 		 317 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0460  hypothetical protein  45.74 
 
 		 318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1885  hypothetical protein  34.13 
 
 		 338 aa  149  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00241335  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  29.52 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  28.83 
 
 		 370 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  28.57 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  27.61 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2255  peptidase M29 aminopeptidase II  25.41 
 
 		 388 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  27.17 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2142  aminopeptidase  27.51 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5702  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  26.79 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696134  normal  0.960092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>