9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4880 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4880  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  254  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232568  normal  0.367106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5428  hypothetical protein  96.77 
 
 		 124 aa  247  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3250  hypothetical protein  80.8 
 
 		 125 aa  207  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.318956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4716  hypothetical protein  79.2 
 
 		 125 aa  200  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.511956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5304  hypothetical protein  78.4 
 
 		 125 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247348  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5556  hypothetical protein  78.4 
 
 		 125 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0103  hypothetical protein  78.4 
 
 		 125 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  39.74 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  34.62 
 
 		 108 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>