18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3823 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3823  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4291  hypothetical protein  98.36 
 
 
61 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5885  hypothetical protein  83.93 
 
 
73 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6204  hypothetical protein  70.49 
 
 
61 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193361 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5880  hypothetical protein  59.02 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6945  hypothetical protein  37.1 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00473369  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6466  hypothetical protein  37.1 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.586082 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5713  hypothetical protein  37.1 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.439977 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7053  hypothetical protein  37.1 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1574  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0480086  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1439  hypothetical protein  35.48 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6389  hypothetical protein  35.48 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418039  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1223  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121352  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1730  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0699  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0845597  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0765  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2424  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1149  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>