17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3128 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2991  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235763  normal  0.0311077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3128  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3098  hypothetical protein  95.58 
 
 
113 aa  207  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.976811 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2466  hypothetical protein  94.69 
 
 
113 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3080  hypothetical protein  94.69 
 
 
113 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3077  hypothetical protein  84.07 
 
 
113 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.247973 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6430  hypothetical protein  91.15 
 
 
113 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.505064 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0396  hypothetical protein  61.02 
 
 
117 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3423  hypothetical protein  61.02 
 
 
117 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0200  hypothetical protein  61.02 
 
 
117 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2164  hypothetical protein  61.02 
 
 
117 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2925  hypothetical protein  61.02 
 
 
117 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3263  hypothetical protein  61.02 
 
 
117 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0212  hypothetical protein  61.02 
 
 
117 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0352  hypothetical protein  43.36 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0079  hypothetical protein  41.67 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4370  hypothetical protein  43.01 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>