12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5522 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5522    100 
 
 		 147 bp  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5756  betaine-aldehyde dehydrogenase  95.92 
 
 		 1494 bp  244  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6864  aldehyde dehydrogenase  87.64 
 
 		 1494 bp  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1371  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 1503 bp  56  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0762191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09710  putative aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 1491 bp  56  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000831166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1689  Aldehyde Dehydrogenase  93.94 
 
 		 1503 bp  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  96.43 
 
 		 1518 bp  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4003  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 1497 bp  48.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 1518 bp  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 1518 bp  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4109  aldehyde dehydrogenase  96.3 
 
 		 1491 bp  46.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7257  aldehyde dehydrogenase  96.3 
 
 		 1518 bp  46.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>