13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3580 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3580  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  323  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998585  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5424  hypothetical protein  82.35 
 
 
85 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164203  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2427  hypothetical protein  51.01 
 
 
147 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3839  hypothetical protein  51.82 
 
 
108 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.801532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4680  hypothetical protein  57.69 
 
 
108 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3683  hypothetical protein  57.69 
 
 
108 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278456  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6176  hypothetical protein  60.53 
 
 
105 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.375857 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1176  hypothetical protein  38.37 
 
 
216 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1520  hypothetical protein  37.21 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19172  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1434  hypothetical protein  37.21 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561698  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0127  hypothetical protein  41.56 
 
 
82 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0349324  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0408  putative lipoprotein  41.56 
 
 
82 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1173  putative lipoprotein  41.56 
 
 
82 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>