34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3488 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3488  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00401228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5307  hypothetical protein  99.49 
 
 		 196 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3573  hypothetical protein  92.35 
 
 		 196 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0597766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3947  hypothetical protein  93.37 
 
 		 196 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180618  normal  0.604818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5109  hypothetical protein  90.31 
 
 		 194 aa  289  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2546  hypothetical protein  87.76 
 
 		 177 aa  287  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5539  hypothetical protein  69.9 
 
 		 194 aa  241  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.642633  normal  0.0183709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2133  hypothetical protein  72.45 
 
 		 192 aa  235  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1751  hypothetical protein  72.45 
 
 		 194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2125  hypothetical protein  69.5 
 
 		 200 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  normal  0.0482024 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1321  hypothetical protein  67.68 
 
 		 259 aa  227  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1544  hypothetical protein  62.76 
 
 		 191 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.210916  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1456  hypothetical protein  62.76 
 
 		 191 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0044  hypothetical protein  62.24 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5721  hypothetical protein  54.91 
 
 		 325 aa  194  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277173  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0057  hypothetical protein  61.42 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3678  hypothetical protein  55.38 
 
 		 188 aa  185  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3695  hypothetical protein  53.14 
 
 		 212 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.841303  normal  0.591313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0498  hypothetical protein  53.14 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.226413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3738  hypothetical protein  58.76 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1304  hypothetical protein  57.52 
 
 		 241 aa  160  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1825  hypothetical protein  56.49 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3014  hypothetical protein  56.52 
 
 		 320 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1231  hypothetical protein  52.67 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0559905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003557  hypothetical protein  47.69 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000457432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02518  hypothetical protein  47.69 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0989  hypothetical protein  48.21 
 
 		 139 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2053  hypothetical protein  38.78 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0738137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0344  hypothetical protein  51.61 
 
 		 178 aa  131  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3132  hypothetical protein  55.36 
 
 		 271 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3233  hypothetical protein  55.36 
 
 		 271 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3034  hypothetical protein  55.36 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2808  hypothetical protein  40.64 
 
 		 186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0150  hypothetical protein  43.36 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>