15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3342 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3342  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5179  hypothetical protein  94.53 
 
 
126 aa  246  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4768  hypothetical protein  81.54 
 
 
128 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3399  hypothetical protein  81.54 
 
 
128 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4117  hypothetical protein  81.54 
 
 
128 aa  191  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6285  hypothetical protein  71.65 
 
 
125 aa  187  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892062  normal  0.385427 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5689  hypothetical protein  73.91 
 
 
122 aa  174  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.118692  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0511  hypothetical protein  53.97 
 
 
155 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0329  putative lipoprotein  53.97 
 
 
155 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738731  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2049  hypothetical protein  53.97 
 
 
125 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3373  hypothetical protein  53.97 
 
 
165 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3043  hypothetical protein  53.97 
 
 
168 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0316  putative lipoprotein  53.17 
 
 
155 aa  139  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2393  hypothetical protein  35.94 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320552  hitchhiker  0.00184098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2209  hypothetical protein  28.91 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116211  normal  0.0459101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>