14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2074 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1531  BipB protein  99.68 
 
 		 620 aa  1222    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0571  BipB protein  99.52 
 
 		 620 aa  1219    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0841  BipB protein  90.43 
 
 		 624 aa  974    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2073  BipB protein  99.68 
 
 		 620 aa  1222    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.449101  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2162  BipB protein  99.35 
 
 		 620 aa  1218    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.824575  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2074  BipB protein  100 
 
 		 620 aa  1227    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0753  BipB protein  99.68 
 
 		 620 aa  1222    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.114383  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3075  cell invasion protein SipB  34.1 
 
 		 593 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3195  cell invasion protein SipB  34.1 
 
 		 593 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3090  cell invasion protein SipB  34.1 
 
 		 593 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000315688 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3038  cell invasion protein SipB  34.1 
 
 		 593 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3007  cell invasion protein SipB  34.1 
 
 		 593 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0160  IpaB  29.73 
 
 		 580 aa  192  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4020  putative type III cell invasion protein SipB  24.02 
 
 		 593 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>