18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0341 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0341  acid-resistance protein  100 
 
 		 114 aa  226  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0312  acid-resistance protein  97.37 
 
 		 114 aa  202  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5125  acid-resistance protein  44.35 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.857439  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4137  acid-resistance protein  41.23 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3828  acid-resistance protein  41.23 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3812  acid-resistance protein  50 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0405653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03311  hypothetical protein  47.73 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.57049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03358  stress response protein acid-resistance protein  47.73 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4869  acid-resistance protein  47.73 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.507411 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3908  acid-resistance protein  47.73 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0207  acid-resistance protein  47.73 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.030642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3996  acid-resistance protein  47.73 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3712  acid-resistance protein  47.73 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00108489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0204  HNS-dependent expression A  47.73 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0086  hypothetical protein  32.39 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1140  acid-resistance protein  34.12 
 
 		 109 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.175542  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3563  acid-resistance protein  34.12 
 
 		 109 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0668033  normal  0.147364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1086  acid-resistance protein  34.12 
 
 		 109 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>