16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9554 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9554  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  323  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409532  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4977  hypothetical protein  63.29 
 
 		 158 aa  215  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8094  hypothetical protein  63.29 
 
 		 157 aa  212  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18901  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4660  hypothetical protein  58.86 
 
 		 158 aa  207  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.928661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4318  hypothetical protein  62.03 
 
 		 158 aa  205  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9166  hypothetical protein  64.33 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0273  hypothetical protein  58.86 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4751  hypothetical protein  62.89 
 
 		 157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3152  hypothetical protein  55.7 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3820  hypothetical protein  53.5 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.487425  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4147  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4595  hypothetical protein  51.9 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0428706  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4478  hypothetical protein  50.96 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0255771  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4752  hypothetical protein  47.77 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.343573  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4959  hypothetical protein  48.51 
 
 		 216 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0379  hypothetical protein  41.4 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>