16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8076 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8076  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  229  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9156  Helicase subunit of the DNA excision repair complex  72.48 
 
 		 115 aa  153  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4969  hypothetical protein  68.52 
 
 		 60 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553476  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4652  hypothetical protein  66.67 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659155  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4469  hypothetical protein  64.81 
 
 		 58 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0261  hypothetical protein  62.96 
 
 		 58 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  60 
 
 		 52 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4310  hypothetical protein  54.55 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0646462  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  42.59 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5552  hypothetical protein  44.44 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.423548  normal  0.0424308 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4969  hypothetical protein  35.19 
 
 		 54 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.689573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  46 
 
 		 54 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  50 
 
 		 55 aa  43.5  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2499  hypothetical protein  38.81 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.421423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  39.19 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4022  hypothetical protein  43.75 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654387  normal  0.0665825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>