22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2997 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2997  Mu-like prophage protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3352  phage virion morphogenesis protein  37.04 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3785  phage virion morphogenesis (putative tail completion) protein  37.34 
 
 		 179 aa  88.2  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3379  Phage virion morphogenesis (putative tail completion) protein  30.21 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4500  phage virion morphogenesis protein  28.57 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0680  phage virion morphogenesis protein  29.14 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0731  phage virion morphogenesis protein  32.45 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1301  phage virion morphogenesis protein  26.67 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2099  phage virion morphogenesis protein  26.67 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.544924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1639  putative bacteriophage protein  27.93 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1290  phage virion morphogenesis protein  29.63 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47294e-24 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0435  phage virion morphogenesis protein  36.97 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1879  phage virion morphogenesis protein  32.62 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1261  phage virion morphogenesis protein  36.71 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2138  phage virion morphogenesis protein  29.49 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0669  prophage MuSo1, virion morphogenesis protein  27.81 
 
 		 150 aa  52.4  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2091  phage virion morphogenesis protein  27.91 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471025  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2926  prophage MuMc02, virion morphogenesis protein  33.94 
 
 		 157 aa  51.2  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2690  prophage MuSo2, virion morphogenesis protein, putative  21.56 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0263  putative phage virion morphogenesis protein  25.55 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1958  hypothetical protein  30.85 
 
 		 167 aa  42  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.692032  normal  0.0722579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3903  hypothetical protein  27.27 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>