13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4976 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4976  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  487  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3737  hypothetical protein  67.67 
 
 
232 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1166  hypothetical protein  68.25 
 
 
218 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1193  hypothetical protein  68.25 
 
 
218 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0507  hypothetical protein  64.22 
 
 
219 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3397  hypothetical protein  54.15 
 
 
245 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0465  hypothetical protein  45.08 
 
 
241 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0793  hypothetical protein  40.25 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0617861  normal  0.0264933 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10671  hypothetical protein  34.06 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2225  hypothetical protein  45.95 
 
 
208 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1592  hypothetical protein  28.97 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.431541  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0771  hypothetical protein  25.94 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0266676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21581  hypothetical protein  23.7 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0770948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>