38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0672 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0672  Septum formation initiator  100 
 
 
121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.98456  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32240  septum formation initiator  50.42 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11042  hypothetical protein  47.86 
 
 
228 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4430  Septum formation initiator  48.25 
 
 
123 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114489  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1955  septum formation initiator  48.15 
 
 
241 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0429748  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4239  septum formation initiator  45.13 
 
 
224 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4325  septum formation initiator  45.13 
 
 
224 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4618  septum formation initiator  45.13 
 
 
224 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0429  hypothetical protein  45.69 
 
 
179 aa  97.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.66413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4770  septum formation initiator  45.79 
 
 
251 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1037  Septum formation initiator  45.69 
 
 
140 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0202  Septum formation initiator  40.34 
 
 
213 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3922  septum formation initiator  36.21 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13996  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0070  Septum formation initiator  40 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  normal  0.200869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8580  hypothetical protein  40.17 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270504  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0808  septum formation initiator  35.4 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5820  Septum formation initiator  35.65 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1908  septum formation initiator  35.92 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3164  Septum formation initiator  43.3 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3131  septum formation initiator  40.34 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.0192356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1019  Septum formation initiator  34.43 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13460  septum formation initiator  38.05 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0402885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1074  Septum formation initiator  37.5 
 
 
212 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0929  septum formation initiator  39.05 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07050  Septum formation initiator  35.71 
 
 
193 aa  57.4  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.805805  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1922  Septum formation initiator  35.58 
 
 
192 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0891  septum formation initiator  34.19 
 
 
208 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0834  septum formation initiator  34.17 
 
 
208 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0910  Septum formation initiator  36.36 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1221  Septum formation initiator  30.89 
 
 
238 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000503385 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0774  septum formation initiator  28.32 
 
 
203 aa  44.3  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.764338  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1148  septum formation initiator  25.89 
 
 
229 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1797  Septum formation initiator  27.27 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07860  septum formation initiator  26.98 
 
 
252 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.321744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1752  cell division protein FtsB  31.96 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.483632  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04990  septum formation initiator  36.45 
 
 
268 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5237  Septum formation initiator  48.61 
 
 
93 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0921  Septum formation initiator  38.83 
 
 
193 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0417966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>