15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1390 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1390  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  240  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4187  hypothetical protein  80.51 
 
 		 119 aa  202  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3432  hypothetical protein  79.66 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275835  normal  0.581055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1176  hypothetical protein  66.67 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1248  hypothetical protein  67.5 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0427  hypothetical protein  60 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2361  hypothetical protein  68.07 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000168319  unclonable  0.000000122129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2402  hypothetical protein  52.46 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2178  hypothetical protein  51.64 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.207131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1617  hypothetical protein  44.8 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0691  hypothetical protein  54.24 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2867  hypothetical protein  50.85 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.438274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0940  hypothetical protein  46.75 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0581  hypothetical protein  41.11 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0739  hypothetical protein  48.1 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355396  normal  0.7194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>