44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1832 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1832  electron transport protein  100 
 
 
131 aa  266  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000966124 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2091  electron transport protein  68 
 
 
125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  47.46 
 
 
116 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  47.27 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  46.96 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  44.14 
 
 
115 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  43.33 
 
 
123 aa  88.2  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  47.52 
 
 
102 aa  87.4  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  54.12 
 
 
98 aa  87  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  44.35 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  43.36 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  44.35 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000713588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7467  electron transport protein  42.11 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  44.9 
 
 
115 aa  84  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000011145  hitchhiker  0.0000321005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  45.83 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  42.48 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  42.48 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5598  electron transport protein  47.13 
 
 
95 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110517  normal  0.627552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  46.15 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2167  electron transport protein  54.29 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147799  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  42.48 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  38.74 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  43 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  38.14 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  34.78 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  37.39 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  34.21 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000873131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  33.93 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  32.77 
 
 
114 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  36.54 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  38.82 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  35.58 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  32.46 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0794  hypothetical protein  31.25 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.907661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  36.67 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681612  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  35.96 
 
 
214 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  34.65 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  32.38 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  32.46 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  30.84 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  32.2 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1296  hypothetical protein  31.76 
 
 
119 aa  40.4  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>