7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0014 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0014  tRNA-Met  100 
 
 
107 bp  212  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0035  tRNA-Thr  94.29 
 
 
101 bp  54  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0019  tRNA-Phe  96.67 
 
 
109 bp  52  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0010  tRNA-OTHER  96.43 
 
 
130 bp  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0006  tRNA-Thr  91.43 
 
 
101 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.35465  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0007  tRNA-Met  96.15 
 
 
78 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000654684  hitchhiker  0.0000516648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0031  tRNA-Ser  96.15 
 
 
89 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.137848  normal  0.0108409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>