31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0274 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0274  disulfide bond formation protein B, putative  100 
 
 
178 aa  347  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0451  protein-disulfide reductase  100 
 
 
178 aa  347  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1931  disulfide bond formation protein B  31.03 
 
 
161 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  26.53 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  28.75 
 
 
159 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  29.94 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  24.2 
 
 
174 aa  47.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0045  disulphide bond formation protein DsbB  29.45 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  28.3 
 
 
159 aa  45.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  26.32 
 
 
168 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  30.61 
 
 
169 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  30.12 
 
 
176 aa  44.3  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  27.59 
 
 
161 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  25.76 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  26.53 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2654  hypothetical protein  26.35 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  25 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1882  disulfide bond formation protein B  26.52 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0159786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  27.78 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  26.35 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  27.33 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  27.46 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  28.24 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  30.77 
 
 
169 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  30.82 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  29.41 
 
 
159 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  27.71 
 
 
176 aa  41.6  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  26.62 
 
 
206 aa  41.6  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0809  disulfide bond formation protein B  25.57 
 
 
168 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.622396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0833  disulfide bond formation protein B  25 
 
 
168 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  27.4 
 
 
175 aa  41.2  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0115369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>