24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0475 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0475  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0480  hypothetical protein  97.51 
 
 
241 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.58191  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0447  hypothetical protein  87.97 
 
 
236 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3544  hypothetical protein  66.82 
 
 
219 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.107447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4150  hypothetical protein  50.92 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4149  hypothetical protein  50.3 
 
 
208 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3151  hypothetical protein  40.95 
 
 
217 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3698  hypothetical protein  41.85 
 
 
211 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0197  hypothetical protein  42.05 
 
 
212 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3235  hypothetical protein  42.47 
 
 
193 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0057  hypothetical protein  43.96 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1284  hypothetical protein  42.47 
 
 
193 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.103295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3458  hypothetical protein  46.43 
 
 
220 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0055  hypothetical protein  42.59 
 
 
214 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000944015 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2973  hypothetical protein  43.07 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454307  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3440  hypothetical protein  44.23 
 
 
202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1621  hypothetical protein  46.06 
 
 
228 aa  121  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1187  hypothetical protein  48.84 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326391  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1177  hypothetical protein  48.84 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1160  hypothetical protein  48.84 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1500  hypothetical protein  47.29 
 
 
205 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624694  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3987  hypothetical protein  39.29 
 
 
158 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3678  hypothetical protein  40.6 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1837  hypothetical protein  41.72 
 
 
187 aa  92.4  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>