| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | UUR10_0420 |
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| Symbol | polC |
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| ID | 6983773 |
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| Type | CDS |
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| Is gene spliced | No |
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| Is pseudo gene | No |
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| Organism name | Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 |
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| Kingdom | Bacteria |
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| Replicon accession | NC_011374 |
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| Strand | + |
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| Start bp | 462620 |
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| End bp | 466948 |
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| Gene Length | 4329 bp |
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| Protein Length | 1442 aa |
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| Translation table | 4 |
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| GC content | 26% |
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| IMG OID | 643399992 |
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| Product | DNA polymerase III PolC |
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| Protein accession | YP_002284813 |
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| Protein GI | 209554353 |
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| COG category | [L] Replication, recombination and repair |
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| COG ID | [COG2176] DNA polymerase III, alpha subunit (gram-positive type) |
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| TIGRFAM ID | [TIGR00573] exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family
[TIGR01405] DNA polymerase III, alpha chain, Gram-positive type |
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Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 14 |
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| Plasmid unclonability p-value | 1 |
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| Plasmid hitchhiking | No |
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| Plasmid clonability | normal |
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Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
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| Fosmid unclonability p-value | n/a |
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| Fosmid Hitchhiker | n/a |
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| Fosmid clonability | n/a |
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Sequence |
| Gene sequence | ATGGAAACAA AAAATGCGTT ATTTAAAAAA ATTGTAATGA TTGATGATGA ACTGTTAGAT
AAAATCAATA TTAAAAAATT AACTAAAGAT AAAAAAAACA ATTTATTTGT TTATTTTAAT
CAATTAGTTG ATGCAACTAT TATTAATGAA TTGCATCAAC TACCAAAAAC AACTTTAATG
CATGATTTGC AAATTTGATA TATTAATGAT CTAAAAGATA TTGATCAAAA AATTTTATTA
ACTTTTTTTA AAAAAATTAG TGAACAAAGT ATTGATTTAG TTTTTTTAGA ACAAATCACT
GATTTAAATA CAAAAATAGA ATATGATTTT GATTTAAATC AATTAAATTT AAAAATCGAT
AATAAATTAA TTTATGATCA TTTCATAACT AATAAATTAA AAATTTTAAA TACTTTAAAA
GCGTGATCAT TACCTTATAG CGAACTTGAA ATCCATTTTG AAAATATTAG TTTAATATTA
AATGAAAATC ACGAACAAGC AGTTAATGAA ATTATTAACC ATCATATACA ACAACAAAAA
CAATTAGAAC AACAAATTAA TCAACAACAA GATTATCAAA ACAATCAAAA ATCAAATTTT
AACTATTACA AAAATACATC TAATAAAACC ATTACAAAAT TAATTGATAT TAATCCTTTA
ATGAATAATG CTAAAATTCA AGCTTATGTT TTTGCAAAAA AAGTTGATGT TTTAAAAAGC
GGAGCAATCG CTTATAAATT AAATGTTATT GATGATAGCG AAACATTAAC GATTATGACT
TATTTATCAA ATAGCGAACA TCCATTAAAA AAGTTTTTAG ATGAATTAAA AAATGACCAA
TTAATTGAAG CCGAGATTGA TATTGTTTTA GATAATATGA GTAAAAGTGG CCAAGTTCCA
ATTGGTAAAA TTAAAAAAAT TTACACTATT CAAGATAATC ATATAAAAAA GACAATTACA
CCTCGTTTAG AATTAAATTT TCATACTAAA ATGTCATCGC TTGATGCGAT TATTTCAGCA
CAAGAATTAA TTGATTTTGC AGTTAAAAAT CAATTAAAAA CAATTGGTAT TACTGATCGA
AATGTTGTCC AATCATATCC TGAAATTGCT AAATTTTCTA AAAAACAAGA TTTAAAAATT
ATTTATGGAT TAGAAACAGA AGAATTAGAA GAGCGAATTC CTTTAGCTTT AAATGTTCGT
GATCAAAATT TAGATGATGC AACATATGTA ATTTTTGATA TTGAAACAAC TGGATTGTTT
CCTAATTTTG ATGAAATTAT TGAATTTGGA GCCATTATTA TGCAAAATAA TAAACAAATT
GGAGATAAAA TTCAATTCTT TGTTAAACCT ATTCAAGAAA TTAATGAAAA CATTACTAAT
TTAACTAACA TTAATCAAGA AATGGTAAAT GATGCAATTG ATGAAAAAAC AGCATTATTA
AAAATCAAAG AAATTTTTGC TAACCATATT TTGGTTGCTC ATAATGGGAT TAGTTTTGAT
ATTAACTTTA TTAATCAAAG ATTATTAAAA TGAGGTTTAG AACCACTTGA AAATCCAAGT
ATTGATACAT TAATGATTTC ACGTGCTATT AATCCTTTTA AAAGTCATCG TTTAGGAGCA
ATTTGTAAAA AATATGAAGT TGACTACAAT GATGAAGTAG CTCACCGTGC AGATTATGAT
GCAATGGTAT TAGCTGATGT TTTTAAAATT ATGAAAAATA GTTTAGTTAA TGACTTTGAA
ATCATTAATT TAAATCAAAT TAACACTAAA TTACAAAGTT TAATGTTAAA AAATCGAAGT
TTTGGAAATT GAGTTAATTT ATATATTAAA ACTCAAGCAA ATGTTAAAGA TATGTACGAA
TTAGTGTCTA TATCACACAC TGATATGTAC TATACAAGAC CAACGATTAC CACAAGTTTT
TTAGCAAATA AAAAAGATAA ATTAATCATT TCAAATTCGG TTCATGAATC TGATTTAATT
AATGCTTTAT ATTCAAAAAG TAATGATGAA ATCAAATCAA TAATGCAACG CTATGATTTC
ATTACTCTAC CATCAATTGG TTCACAAAAA CATTTAGTAT ATGCTAAAAA AATCACACTT
GAGAATGTAC AAAAAGCTTT TAAAAAATTA GTAAGTTTAG CTTTAGAATT AAACAAAATT
ATTATTTATT CAAGTTCGCC TTATTATTTT TTAAAAGATG ATAAGAAATT TTATGATGTT
TATGTTAACA CTAAAGGGCT TGAAGGTAAA TCACATCGTT TCGCTAATGA AGAATATGTG
CCAGATTTAG AGTATGTTGA TCAAAAAAGT GCGATTGATG AACTTGCTTA TTTAGAAGAT
GAAAATTTAA TTAATTTAAT TATTAATGAA AATCCACAAA TCATTAATTC ATGATTTGAT
GATAAAATCC AACCTTTAAA AGAGGGATTG TATGCTCCAA AAATGGAGGG AGTAGATCAA
AAAACAATTG ATTATGTTTA TCATACAGCT AAAAAAATCT ATGGCGATAA TCTACCGACA
ATTGTCGAAC AACGTATTAA AAAAGAATTA GATTCGATTA TTAAGCATGG ATTTAGTGTT
GTTTATTGAA TTTCACATTT ATTAGTAGAA AAATCAATGC AAGATGGTTA TGGAGTTGGA
AGTCGTGGTT CTGTTGGATC ATCACTTGTG GCAACATTTT TAAATATTAC TGATGTTAAT
CCATTGGCCC CTCATTATTT ATGTCCAAAA TGTAAAAAAT GTGAATTTAT AACCAATGCT
GATGATGGGT TTGATTTAGT TCCGAAAGAT TGTGAACAAT GTCAAATTCA AATGTTAACT
GATGGTCATA ATATTCCTTT TGAAACATTT TTAGGATTTG ATGGGGATAA AGTACCTGAT
ATTGATTTAA ATTTCTCTGG TGTTTATCAA GCGGTTGCTC ATAATTTTAT TAAAAGTATT
TTTGGTGAAA CACATTCATA TCGTGCTGGT ACAATTGGTA CAATGGCTGA AAAAAGTGCT
GAAAATGCTG TTAAAAAATA TTTTGAAAAT CGTTTTAGTG AAAATCAAAT TGTTCGTGAT
TCAACAGTTA GTTTATATGT TCAAAAATGT ATTGATTCAA AACGAACTAC AGGTCAACAC
CCTGGGGGAA TTATTATTGT TCCTAAAGAA TATAGTATTT GGGATTTTTC ACCTTATAAT
TTTCCAGCTA ATGATATTAA TGAAACTTGA AAAACAACGC ACTTTGCGTT TGAATATTTA
CATGATAGTT TGCTTAAATT TGATATTTTA GGACACGATA ATCCAACGAT TTTAAAACTT
TTAAAAGACT ATACTGGAAT TGATGATCGT GATGTGCCAA TGTATGATCC ATTGGTTATG
AAATTATTTA GTGATATTAG TGCACTAAAC ATTAAACCAT CAGATGTTTT AAATGAAACA
ACAGGAGCTA TTTCAATTCC TGAATTTGGA ACTCGTTTTG TTCGGGGAAT GCTAGTTGAT
ACTAAACCCA AATCATTTGC TGACTTAATT CGAATTTCTG GTTTATCTCA TGGAGAAAGT
GTTTGATTAG GTAATGCTCA ATCATTAATT AAATCTGGAA AACTACTAAA AGATGTTATT
GCTTGTCGTG ATGATATTAT GACTTATTTG ATTCGTCAAA ATGTTGAACC AAAAACTGCT
TTTTTAATTA TGGAAGATGT AAGAAAAGGT AAAAAAATTA AACCTGAACA TCAAAGTATT
TTAAAAGAAT TAAAGATTCC TGAATGATAT ATTGAATCAG CTAATAAAAT TAAATACATG
TTCCCTAAAG CCCATGCGAC AGCTTATGTT ATGCACGCAT GAAAGTTTGC GTGATATAAG
ATTTATCATC CACTAGAATA CTATGCAGCA TTTTTTAGTG TTCGTGCTGA TAATTTTGAT
TTGTTTGTAA TTAATCAAGG AAAAGAGTTT ATTGAAAAAA CTTACAATGA TATTGAACAA
CGCTCAAAAT CACGAGATCC ACAAAAAAAA GTGAGTTCAC GTGAACTTGC TTTACAACCA
ATTTATGAAA TTGTGATTGA ATTATTAGCT CGGGGTTTTA AAATTTCAAA TATTAGTATT
GAACAATCAC AGGCAACTAG TTATGTAATT GATAAACAAA ATAATGCCAT TATTCCACCA
TTTGTGGCTA TTCAAGGCTT GGGTGAAACA GTGGCTAATT CCATTATTGA AGCACGTAAT
CAAAAAGCTT TTTCAACAAT TGAAGATTTA AAAAATCGAA CAAAAATTTC ACGAACTGAT
TTAAAAAATT TACGTGAATT AGGTGTATTA GATCATTTAA GTGAGACTGA ACAATTAACA
TTATTTTAA
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| Protein sequence | METKNALFKK IVMIDDELLD KINIKKLTKD KKNNLFVYFN QLVDATIINE LHQLPKTTLM
HDLQIWYIND LKDIDQKILL TFFKKISEQS IDLVFLEQIT DLNTKIEYDF DLNQLNLKID
NKLIYDHFIT NKLKILNTLK AWSLPYSELE IHFENISLIL NENHEQAVNE IINHHIQQQK
QLEQQINQQQ DYQNNQKSNF NYYKNTSNKT ITKLIDINPL MNNAKIQAYV FAKKVDVLKS
GAIAYKLNVI DDSETLTIMT YLSNSEHPLK KFLDELKNDQ LIEAEIDIVL DNMSKSGQVP
IGKIKKIYTI QDNHIKKTIT PRLELNFHTK MSSLDAIISA QELIDFAVKN QLKTIGITDR
NVVQSYPEIA KFSKKQDLKI IYGLETEELE ERIPLALNVR DQNLDDATYV IFDIETTGLF
PNFDEIIEFG AIIMQNNKQI GDKIQFFVKP IQEINENITN LTNINQEMVN DAIDEKTALL
KIKEIFANHI LVAHNGISFD INFINQRLLK WGLEPLENPS IDTLMISRAI NPFKSHRLGA
ICKKYEVDYN DEVAHRADYD AMVLADVFKI MKNSLVNDFE IINLNQINTK LQSLMLKNRS
FGNWVNLYIK TQANVKDMYE LVSISHTDMY YTRPTITTSF LANKKDKLII SNSVHESDLI
NALYSKSNDE IKSIMQRYDF ITLPSIGSQK HLVYAKKITL ENVQKAFKKL VSLALELNKI
IIYSSSPYYF LKDDKKFYDV YVNTKGLEGK SHRFANEEYV PDLEYVDQKS AIDELAYLED
ENLINLIINE NPQIINSWFD DKIQPLKEGL YAPKMEGVDQ KTIDYVYHTA KKIYGDNLPT
IVEQRIKKEL DSIIKHGFSV VYWISHLLVE KSMQDGYGVG SRGSVGSSLV ATFLNITDVN
PLAPHYLCPK CKKCEFITNA DDGFDLVPKD CEQCQIQMLT DGHNIPFETF LGFDGDKVPD
IDLNFSGVYQ AVAHNFIKSI FGETHSYRAG TIGTMAEKSA ENAVKKYFEN RFSENQIVRD
STVSLYVQKC IDSKRTTGQH PGGIIIVPKE YSIWDFSPYN FPANDINETW KTTHFAFEYL
HDSLLKFDIL GHDNPTILKL LKDYTGIDDR DVPMYDPLVM KLFSDISALN IKPSDVLNET
TGAISIPEFG TRFVRGMLVD TKPKSFADLI RISGLSHGES VWLGNAQSLI KSGKLLKDVI
ACRDDIMTYL IRQNVEPKTA FLIMEDVRKG KKIKPEHQSI LKELKIPEWY IESANKIKYM
FPKAHATAYV MHAWKFAWYK IYHPLEYYAA FFSVRADNFD LFVINQGKEF IEKTYNDIEQ
RSKSRDPQKK VSSRELALQP IYEIVIELLA RGFKISNISI EQSQATSYVI DKQNNAIIPP
FVAIQGLGET VANSIIEARN QKAFSTIEDL KNRTKISRTD LKNLRELGVL DHLSETEQLT
LF
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