Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | Strop_2780 |
Symbol | |
ID | 5059243 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Salinispora tropica CNB-440 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_009380 |
Strand | - |
Start bp | 3165680 |
End bp | 3174781 |
Gene Length | 9102 bp |
Protein Length | 3033 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 69% |
IMG OID | 640475034 |
Product | beta-ketoacyl synthase |
Protein accession | YP_001159600 |
Protein GI | 145595303 |
COG category | [Q] Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism |
COG ID | [COG3321] Polyketide synthase modules and related proteins |
TIGRFAM ID | [TIGR00128] malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | 11 |
Fosmid unclonability p-value | 0.564666 |
Fosmid Hitchhiker | No |
Fosmid clonability | normal |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGGCGAACG ACGACAAGCT CCGGACCTTT CTCAAGCGCG CTACGGCCGA ACTGCAACAG GCCAACCGGC GACTGCGTGA GGTGGAGGAC CGGGACCAGG AGCCGATCGC GATCGTCGGC ATGGGCTGCC GCTACCCCGG GGGTGTCCGG TCGCCGGAGG ACCTGTGGCA GCTCGTCCTC GACGGCACCG ACGCGATCTC CGACTTTCCG ACCGACCGGG GTTGGGACGT CTACGGCGTC TATGACCCGG AACCCGGCAA GCCCGGCAAG AGCTACACCC GGCACGGCGG CTTCCTCTAC GACGCCGCCG ACTTCGACCC GGGCTTCTTC GGGATGAGCC CACGGGAGGC GGTGGAGACG GACCCGCAGC AGCGGCTGGT GTTGGAAGCA TCCTGGGAGG CGTTCGAGCA CGGTGGCATC GACCCGGTCG GCTTGAAGGG CAGCACCACC GGCGTCTTCG TCGGCATGAT GCACCACGAC TACGTCGACA GCACCACCTC CGGCAGCCTC GTCTCCGGCC GGGTCGCGTA CGTGCTGGGT CTGGAGGGGC CGGCGATCAC CGTGGACACC GCGTGCTCGT CGTCGTCGGT CGCGGTGCAC CTGGCCTGCC AGTCGCTGCG CAGGGAGGAG TGTGGCCTGG CGCTGGCCGG TGGCGTCGCG GTGATGGCCA CCCCACAGCT CTTCGTCGAG TTCAGCCGGC AGCGCGCGCT GTCCCCGGAC GGCCGGTGTC GGTCCTTCGG CGACGGCGCC GACGGCGCAG CCTGGTCCGA GGGTGTTGGT GTGTTGGTGT TGGAGCGGTT GTCGGATGCT CGCCGGAATG GTCATCGGGT GTATGGGGTG GTGCGGGGTT CGGCGGTGAA TCAGGACGGT GCGTCGAATG GTTTGACGGC 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TCGTGTTGTT CTCCTCCGGG GCGGCGGTGT GGGGCAGTGC CGGGCAGGCC GGTTACGCCA CCGCGAATGC GTACCTCGAC GCGTTGGCCC ATCGGCGGCG GACCCGCGGC GTGGTCGCCA CCTCCGTTGC CTGGGGCAGC TGGGGCGGCG GCGGCATGGC CGGCGGCGAG GTCGGCGCGC ACCTGCGCCG ACAGGGCACC CCGCCGATGG ACCCCGGGCT CGCTGTCCAG GCGCTACGGC AGGCTCTCGA CCACGATGAG AGTCACCTCG TCGTCGCCGA CATCGACTGG GCCCGGTTCG CCCCGATCTA CACTCTGGCC CGGCCACGGC CGCTGCTCAC CGCGCTCCCC GACGCCCACC CGGAGAGCGA ACCGGCCACC CCGGTCGCCG CCACCGCCGA CCTCGCCGGA CAGCTCGCCG CGATGCCGAC ACCGGACCGC CTGGACACCA TCCTCGCACT GGTCCGCGAC CAGGTCGCCG CCGTCCTCGG GTACGCCTCC GACGCCGACG TAGAGCCAGA GCGGGCGTTC AAGGAAGCCG GCTTCGACTC GTTGACCGCC GTCGAGCTGC GCAACCGGCT CGCCACCGAG ACCGCGCTGC GGCTGCCCGC CACGCTGGTC TTCGACCACC CGACCCCGAT CGAACTGGCC CGGCACCTGC TCACCGAGCT GGCGCCCGCC GACGCGGGGG GCGTCACCCT GCTCAACGAC CTCGACCGGC TCCAGGCGAC CTTGTCCACG CTGGACACTG ATGCGGTGGC CGCTCTCGAC GAGAGCATCC GTGCCGGGGT GGGGGAGCGG CTCAAGGCCC TGCTCGCGAC CTGGACCGCC GATCAACGCC CGGCCGAGGT CGTCAGCGTG ACCGAGGACC TCGACACCGC CTCCGACGAC GACCTCTTCG AATTCATCGA TAGCAAGTTC GGCACCTCAT GA
|
Protein sequence | MANDDKLRTF LKRATAELQQ ANRRLREVED RDQEPIAIVG MGCRYPGGVR SPEDLWQLVL DGTDAISDFP TDRGWDVYGV YDPEPGKPGK SYTRHGGFLY DAADFDPGFF GMSPREAVET DPQQRLVLEA SWEAFEHGGI DPVGLKGSTT GVFVGMMHHD YVDSTTSGSL VSGRVAYVLG LEGPAITVDT ACSSSSVAVH LACQSLRREE CGLALAGGVA VMATPQLFVE FSRQRALSPD GRCRSFGDGA DGAAWSEGVG VLVLERLSDA RRNGHRVYGV VRGSAVNQDG ASNGLTAPNG PAQQRVIRAA LANARLSVSD VDVVEAHGTG TTLGDPIEAQ AIVATYGRDR DRPLWLGSVK SNIGHAQAAA GVAGVIKMVM AMRHGVLPRT LHVETPSRQV DWSAGDVRLL TESVEWPAVD RPRRAGVSSF GISGTNVHLI IEQASPVEDQ APVEDSATGP TPPVTLWPVS GRSLEGLAGQ AGRVAGFCGG VGVRAVDVGL SLGVGRAGLE FRGVAVGREV SELSAGLEVV AAGGGVSGRV SSGRTAVLFS GQGAQWVGMG RELAGAFPVF AGALAEVCGV FGPLLGGDLR EVMFVDGGGV LDRTGWAQPA LFAVEVALFR LAESWGLVPD FVVGHSVGEL VAAYVSGVWS LEDACRVVAA RGGLMEGLPG GAMLAVGGSV GELELGGVDV AAVNGPRSVV VSGTEEEIAG LEGSLGVWTR RLRVSHAFHS RLMDPMVADF GRVVGGVRGR VGGVAVVSTV TGEVVTDEVL GSVGYWQGQV RGTVRFADAV ATLVERGVTR FVEVGPDSVL TGLVAECVPE AAVVVGLQRR GGDQVRAFAA GMGRVWAAGV DLDWAAVHPG GRQVDLPTYA FQHQHYWLHD TGADKDVSTA GWRYRVMWRA TNVPTGRHLT GDWWVVTPSA LTDDPRAAAV ADALTARGAT VVRLTDAAPH DRDTPAGVVS LLGLDDTSDT LNAGLSAGVT GTVRLVHALA AADFTGRLWC LTTGAVAVDP YEDLPHAAQA GLWGLGTVLS LDYPGWWGGL ADVPADWTPD ILDRLVDVLT DGGEDQVALR NGGVLARRMV HWPVSGTPDR RWRPTGTVLV TGGTGGIGTH LSEWLLDQGA DRVVLASRRG PAALGAADLA ARLPAVQVVA CDVTDRDAVA TLLDGIGDDL TAVFHAAGVL RDAAPLDETD LDAFADVCRA KVLGATHLDA LLADRPLDAF VLFASGAAVW GSAGQAAYGT GNAWLDALAH QRRRQGRTAT SIAWGTWGGG GMVDDQATEQ LLRQGTPPME PRLALGALQQ VLDHDESHLV VADIDWARFA PIYTLARPRP LLAALPEANP SVVATAPAPP RETSVLADLP DADRLPYLLD TVRTHVAVVL GYDASTTVDV QRPFRELGFD SLTAVELRNA VGEAVGLRLP ATMVYDHPTP AVLARHLYDE LVGTAAAPTV TSTTAGFAPD EPIAIIGMGC RYPGGVRSPE DLWQLVATGT DAISAFPVDR GWDADALFDA DPDQPGTSYV RSGGFVYDAA KFDAEFFGIS PREAIAMDPQ QRLMLEVTWE ACERAGLNPE ALRGSSVGVF VGSGAQDYGD LLGLAPAESE AYLSTGTSAS VISGRLSYAF GFEGPSMTID TACSSSLVAL HLASQALRAG ECATAIASGV LVMSNPTPFV AFSRQRGLAP DGRCKSFSDD ADGTGWSEGV GVLVLERLSD ARRNGHRVYG VVRGSAVNQD GASNGLTAPN GPAQQRVIRA ALANARLSVS DVDVVEAHGT GTTLGDPIEA QAIVATYGRD RDRPLWLGSV KSNIGHTQAA AGVAGVIKMV MAMRHGVLPR TLHVETPSRQ VDWSAGDVRL LTESVEWPAV DRPRRAGVSS FGISGTNAHV VLEQAPLVGD EESVGLVEVV DPPVVLWPVS GRSLEGLAGQ AGRVAGFCGG VGVRAVDVGL SLGVGRAGLE FRGVAVGREV SELSAGLEVV AAGGGVSGRV SSGRTAVLFS GQGAQWVGMG RELAGAFPVF AGALAEVCGV FGPLLGGDLR EVMFVDGGGV LDRTGWAQPA LFAVEVALFR LAESWGLVPD FVVGHSVGEL VAAYVSGVWS LEDACRVVAA RGGLMEGLPG GAMLAVGGSV GELELGGVDV AAVNGPRSVV VSGTEEEIAG LEGSLGVWTR RLRVSHAFHS RLMDPMVADF GRVVGGVRGR VGGVAVVSTV TGEVVTDEVL GSVGYWQGQV RGTVRFADAV ATLVERGVTR FVEVGPDSVL TGLVAECVPE AAVVVGLQRR GGDQVRAFAA GMGRVWAAGV DLDWAAVHPG GRQVDLPTYA FQHQHYWIEP DRTDGTATDG TATDGTATDG TATDGTDGGF WDAVERADVD ALADGLGVAP DVVDEVLPGL AAWRSRHRDA STLDGWRYRV VWRSTDLPVG GELSGAWWVV VPVTLAGDAR VRAVIEGLAA RGAEVVMVVG VDLPVGDIPA GVVSLLALDD SRDDTGVGLS AGVVDTVRLI QALAVTGRMG RVWCVTSGGV AIDRFEPVID LAQGALWGLG TVLSLDYPDW WGGLVDLPVD WTDAHVERFV DVLADGGEDQ VAVRTVGVLA RRMVRWPAVG TSERRWRPSG TVLVTGGTGG VGEHVTEWLL AGGADRVVLA SRRGLDAPGA ADLVARHRGV DVVVCDVADR DAVAALLADL GDDLTAVFHA AGVLRPEVPL GETGLDDFAD VCRAKVLGAV HLDALLADRP LEAFVLFSSG AAVWGSAGQA GYATANAYLD ALAHRRRTRG VVATSVAWGS WGGGGMAGGE VGAHLRRQGT PPMDPGLAVQ ALRQALDHDE SHLVVADIDW ARFAPIYTLA RPRPLLTALP DAHPESEPAT PVAATADLAG QLAAMPTPDR LDTILALVRD QVAAVLGYAS DADVEPERAF KEAGFDSLTA VELRNRLATE TALRLPATLV FDHPTPIELA RHLLTELAPA DAGGVTLLND LDRLQATLST LDTDAVAALD ESIRAGVGER LKALLATWTA DQRPAEVVSV TEDLDTASDD DLFEFIDSKF GTS
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