Gene Mbur_2267 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagMbur_2267 
Symbol 
ID3997221 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameMethanococcoides burtonii DSM 6242 
KingdomArchaea 
Replicon accessionNC_007955 
Strand
Start bp2389106 
End bp2393665 
Gene Length4560 bp 
Protein Length1519 aa 
Translation table11 
GC content41% 
IMG OID637959995 
ProductTPR repeat-containing protein 
Protein accessionYP_566878 
Protein GI91774186 
COG category 
COG ID 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGTCACAAA GATCAAAAGA TATGGCACTT CGTAATTTCA AAAAAGGGAT GTCCTTTTTA 
GAAGCCGGAC AACAGAAAAA AGCTCTTGAA GTATTGCTTG TTGCTGAAAA ACAAGCAAAG
GACGCAGGCT CTACGGATCT GCTAATAAAT ATTTTTCAAT CGGTTGCAAA AATAATGGAA
TCCAACGGCG AAAAGGATGC AGCCCTTGAG AGGTACTTGG GTGCATCTGA GCTACTAGAC
GGTCTTGCAA ACTCGGATCC TTCATTTGTG GAGCACAAAG CCCTTGCTAT GAACAAGGCC
GCCACCCTTC TTGCCAATAA AGGCGATGTG GAACATGCCG GATATTTATT TGAAGAAACA
GTGAAAGCAT ATGATAAACT GCTTTCAAAG GAGCCGAATA ATGTTGTCCA TTGTTCATCC
ATGTCTTCTG CACTCAATGA TGTTGCTACC ATCCTCGCCG AAAGGGGTCA GCAAAAGGAT
GCAAAAGAAA GGTTCGAAAG ATCCCTTAAG TTATCGGCTA AGCTCATTGT ACTCGACCCT
CTGAACAGTT CTAATATTAC AAAAGCTCTG ACAATTCAGA CAAATCTTGC TAATCTTCTC
TACGATATGG GACTCCTGGA AGATGCAAAA ATAAATTTTG AAAGCACTTA TGGAGGATAT
TCCGGGCTGC TAAAGGATAA TACATCTGGC AATTTGTTCC GTGATCAAAT TGCAGATACA
CTGGAAAAAC AGGTAAATGT CCTTTTTGAT ATGCAGGAAT ATGCTGCTTC CGGCAAGAAG
CTTCATGAAC TGATGGATAT GCTTCAAAGG TTCGCAAAGG ATGAACCTCG TTTTCTTGAA
AGGATTACTG ATCCTATTCA CGGACTGGTA AAGCTTGCTC GTGACAATGC AGACAAGGGG
ATGTTTGCCG ATGCCCGTTC AGGGTATGAG CTTATGCTTC CTGTTCTGAT GGATTTGATA
AAGGATGATC AGGATTATGC AAATTACATT CCAATGGTCC GTACGATGCT TAATGATATG
GAATCTCTTC TCGAAAATGA TACTGATGTC AGCGAAAAGG AAGCCGATCT CACTATCCTG
ATCTCTATGT ACGAGAATCT TTCCGCTCTT GATCCTTCTG ATCTCTCCTA TGCTGGAAAG
ATCTCTGAAC TCAATGACCG CATGGTACAG CTTTTGATAG TTGCTGGTCG TTTCGAGGAT
GCTCGTTCAA AATCGGATCT CACTCTTGAC GACCTCATGG ATCTGATGCA GAAGGACCCT
AATAATGTCA ATTTACTTTC CATGATCCGT GAGATGCTGG ATGATATGGA ATTTCTTCTT
GAAACTGATC GTGATGTCAA CGAACATAAA TCTAATCTCA ATACCCTCAT CTATATGTAC
GAGAATCTTT CCGATATTTA TCCTTCTGAC GTATCTTATG TTACAAAGAT CTCCGATCTC
GATAACTGCA TGATACGTCA TTTGATAAAC GCCGGTTGTC TTGCTGAAGC TCGTTCAAAG
TCTGATTCCA CTCTTTACGT TCTTATGGAT ATGGTCCATG AGGATCCTGA AAATGTCAAT
TTACTTTCAA TGATCCATGA GATTCTGGAT GATATGGAAT CTCTTCTTGA CACTGAAATG
GATGCCAGCA AACAGGAATC AAGCCTCAAT GTCCTGATCT CCATGTACGA GATGCTTTCC
AGAATCGATC CTTCTGACTT TTCCCACCAT GTAAAGATCG CCAAACTCAA TGAGCGCATG
GGTCGTTTTT TAATGGATGC TGGTCGTCTC TCTGCTGCTC GCTCAAGTTA TGGTTCCACA
CTTGCTGTTC TGACGAAATT GATCAAGGAA GAGCCTGATA ATACCAATTT CCTTTCGACC
TTCCGTACGA TAGTAAATGA TATGGAAGTT CTTTTTGAAA TGAATGCTGA TGACGGTGAA
AAAGGATCTG ATCTCAATGT TCTTACCTCG ATATACGAGA AGCTTTCCAT TCTTGATCCC
ACCGACCTCT CCCATTACGT GAAGATCGCC GAACTCAATG AGCGGGTGGG CAGCCTTTTA
ATGAATGCTG GACGCCTCGC TGCTGCTAGG TCAAAGTATG ATTCTGCACT TACTGTTCTG
ATGGATCTGA TACAGGATGA TCCTGACAAT TTTACTTTCC TTTCTATGTT CCGTACTCTA
CTTGCCGATA TGGAACATCT TCTTGAGGTT GATTGTGCTG ATAGCGAAAA GGAATTTGAT
CTCAATGTTC TTATCTCTAT GTACGAGAAA CTTTCACAGC TTGACCCCTC CGATCTCTCC
TACTATGTGA AGATCGCCGA ACTCAATCAG CGCATGGGTA ATGTTCTGAT GAAAGCTGGT
CGTCTCTCTG CTGGTCGGTC AAAATACGAG TCCACATTTA ATGATCTGGT GGAACTTATC
AATGAGGATC CTGAGAATGT CACATTCCTT TCTATGGTCC GTACTATAGT TACTGACATG
GAAGCCCTCA TCAAAATGAA CGATGATGAT AGTGAAAATG AATATGCTTT CAATGTCCTC
ATCTCTATGT ATGAGAAGCT TTCTGTTCTT GAACCTTCAA ATCTCTCCTA TCCGGCAAAG
CTCGCCGAAC TCAATGAGGG AATGATCATC CTTTTGATAA GTGGTGGTCG TCTTGCCGAT
GCCCGTTCAA AATATGATTC CACCCTTAAC GTTCTTATGG ACCTGTTACA AAAGGAATCT
GATAATGTCA CTTTCCTTTC CATGATACGT ACGATACTTA GTGACATGGA ATATCTTCTT
GAGACTTATA GTTCTGAAAC TGAAAAGGAA GCTGAACTCA ATGTCCTCAT TTCTATGTAC
GAGAAGCTTT CCACTTTGGT TCCTTCCGAT CTCTCGCATC ATACAAAGCT CACCGAACTC
AATGACCTCA TGATCCTTCT TTTGATAAAT GGTGGTCGTC TCGATGATGC GTGTTCAAGG
TCCGATTCCA TCCTTGATGT TCTTATGAAT CTGGTGCAAA AAGAGCCTGA TAATTTTACT
TTCTTTTCCA TGATCGGTAC TATACTAACT AATATGGAAT CTCTTCTTGG AACTGAAAAT
GATGCCAGTA AAAAGGAAGC CGATTTCAAT TTCCTCATGT CAATGTATGA GAAGCTTTCC
ACTCTTAATC CTTCCGATCT CTCGTATCAT GCAAAGATAG CTGAACTCAA TGAGGGCATG
GTTCTTACTT TGCTAACTGC TGGTCATCTT GATGCTGCCC GTGCAATGTC TGATTCCACG
CTTGATGTTC TTATGGGTCT GGTTCAGAAG GAGCCTGATA ATGTCACTTT CCTTTCCATG
ATCGGTACTA TACTAACTAA TATGGAATCT CTTCTTGGAA CTGAAAGTGA TGCCAGTAAA
AAGGAAGCTG ACCTCGATTT CCTTATCTCT ATGTATGAGA AGCTTTCCAC TCTGGTTCCT
TCCGATCTCT CGTATCATGC AAAGATCGCT GAACTCAATG AGGGCATGAT CATCCTTTTG
ATAAACGCAG GTCGTCTCGA TGATGCGTGT TCAAGGTCTG ATTCCATCCT TGATGTTCTT
ATGGATCTGG TTCAGAAGGA TCCTGATAAT GTCACTTTCC TTTCCATGGT CCGTACTATA
CTAACTGATA TGGAATCTCT TCTTGATACG GAATTTGATG CCAGTAAAAA GGAAGCCGAT
TTCAATTTCC TCATATCAAT GTATGAGAAG CTTTCCACTC TTAATCCTTC CGATCTTTCG
TATCATATAA AGATCGTAGA ACTCAATGGG ATAATGATCG GTCTTTTGAT GAATGCTGGT
CGTATTGATG ATGTCCGTTC AATGTATGGT TCCACTCTTA ATATCCTGAT GAAATTGATG
CAAGGGGAAC CTGAAAATGT CACTTTCATT TCTATATTCC GTAATGTATT GTCGGATATG
GAAAGTCTTC TTGAAATTGA CTGTGATGAG AGTGAAAAAG AAGAAGATCT CAATGTCCTG
ATCTCGATGT ACGAGAAGCT TTCTCTTATT GATCCATTTG ATCTTTCGCA TCATACGAAA
GTAGCTGATC TCTATGATCG CAAGGGCAGT TTCTTAATGA ATGCAGGTAG GAATGTTGAT
GCCCGTTCAA GTTATGAAAT GGCATTAAGC ATAAGGAAAA TGCTTATCGA AAAAGGCGAA
TCATCAATGC TGCAGGAGTT CGGAATAGCT TCTATCAGGA ACAACCTCGG TACGATGTTT
GCACAGGATG GCGAGTTCAC AGAAGCCAAA GCAATGTTCG AGGCTTCCCT TAAAACGTAT
GTCGATCTTT TTGACAGGGA TAAAGAGGAT GCAGCATATC AGTACGGTGC TGCTCTTACA
TTGAACAATC TTGCAAAACT GTTCGCTGAT ATGGGTCGCC ATGAAGATGC AAAGAGCATT
TATGAATCAG CACTTGAGGC ATATGTTGAA TTGCTGAATG CTGACCCGGA GAATGTTCGT
TACAAGAAAC ACGCTTCCAT AACCCTTGAT AATCTTGGTT CATTGCTTGG TGAGATGGGA
AGGGGAGAAG ATTCTATCCG TATGCATGAG GCAGCACAGG AATTAAGAAA CGAGATCTGA
 
Protein sequence
MSQRSKDMAL RNFKKGMSFL EAGQQKKALE VLLVAEKQAK DAGSTDLLIN IFQSVAKIME 
SNGEKDAALE RYLGASELLD GLANSDPSFV EHKALAMNKA ATLLANKGDV EHAGYLFEET
VKAYDKLLSK EPNNVVHCSS MSSALNDVAT ILAERGQQKD AKERFERSLK LSAKLIVLDP
LNSSNITKAL TIQTNLANLL YDMGLLEDAK INFESTYGGY SGLLKDNTSG NLFRDQIADT
LEKQVNVLFD MQEYAASGKK LHELMDMLQR FAKDEPRFLE RITDPIHGLV KLARDNADKG
MFADARSGYE LMLPVLMDLI KDDQDYANYI PMVRTMLNDM ESLLENDTDV SEKEADLTIL
ISMYENLSAL DPSDLSYAGK ISELNDRMVQ LLIVAGRFED ARSKSDLTLD DLMDLMQKDP
NNVNLLSMIR EMLDDMEFLL ETDRDVNEHK SNLNTLIYMY ENLSDIYPSD VSYVTKISDL
DNCMIRHLIN AGCLAEARSK SDSTLYVLMD MVHEDPENVN LLSMIHEILD DMESLLDTEM
DASKQESSLN VLISMYEMLS RIDPSDFSHH VKIAKLNERM GRFLMDAGRL SAARSSYGST
LAVLTKLIKE EPDNTNFLST FRTIVNDMEV LFEMNADDGE KGSDLNVLTS IYEKLSILDP
TDLSHYVKIA ELNERVGSLL MNAGRLAAAR SKYDSALTVL MDLIQDDPDN FTFLSMFRTL
LADMEHLLEV DCADSEKEFD LNVLISMYEK LSQLDPSDLS YYVKIAELNQ RMGNVLMKAG
RLSAGRSKYE STFNDLVELI NEDPENVTFL SMVRTIVTDM EALIKMNDDD SENEYAFNVL
ISMYEKLSVL EPSNLSYPAK LAELNEGMII LLISGGRLAD ARSKYDSTLN VLMDLLQKES
DNVTFLSMIR TILSDMEYLL ETYSSETEKE AELNVLISMY EKLSTLVPSD LSHHTKLTEL
NDLMILLLIN GGRLDDACSR SDSILDVLMN LVQKEPDNFT FFSMIGTILT NMESLLGTEN
DASKKEADFN FLMSMYEKLS TLNPSDLSYH AKIAELNEGM VLTLLTAGHL DAARAMSDST
LDVLMGLVQK EPDNVTFLSM IGTILTNMES LLGTESDASK KEADLDFLIS MYEKLSTLVP
SDLSYHAKIA ELNEGMIILL INAGRLDDAC SRSDSILDVL MDLVQKDPDN VTFLSMVRTI
LTDMESLLDT EFDASKKEAD FNFLISMYEK LSTLNPSDLS YHIKIVELNG IMIGLLMNAG
RIDDVRSMYG STLNILMKLM QGEPENVTFI SIFRNVLSDM ESLLEIDCDE SEKEEDLNVL
ISMYEKLSLI DPFDLSHHTK VADLYDRKGS FLMNAGRNVD ARSSYEMALS IRKMLIEKGE
SSMLQEFGIA SIRNNLGTMF AQDGEFTEAK AMFEASLKTY VDLFDRDKED AAYQYGAALT
LNNLAKLFAD MGRHEDAKSI YESALEAYVE LLNADPENVR YKKHASITLD NLGSLLGEMG
RGEDSIRMHE AAQELRNEI