Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | MCAP_0511 |
Symbol | |
ID | 3828456 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_007633 |
Strand | - |
Start bp | 609596 |
End bp | 614857 |
Gene Length | 5262 bp |
Protein Length | 1753 aa |
Translation table | 4 |
GC content | 21% |
IMG OID | 637823667 |
Product | hypothetical protein |
Protein accession | YP_424484 |
Protein GI | 83319322 |
COG category | [Q] Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism |
COG ID | [COG3127] Predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component |
TIGRFAM ID | |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 0.665267 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | n/a |
Fosmid unclonability p-value | n/a |
Fosmid Hitchhiker | n/a |
Fosmid clonability | n/a |
| |
Sequence |
Gene sequence | ATGAAAAGAA TATATAGCTT TTTTTTGTTA TTAAAACAAG GACTTAAAGG TGTTTTTAAG TTTAAAATTC AGTTTATTAT TATTCTTTTA TTATCTTTTT TAGCTTCATT TATTTTAAGC ACTTCTCTTA CTTTAACTTC AAGAATTAAT AAAACTTATA ATAATATAGT TAATAATGTA AATAAATTTG ACTATAGTAG TTCTAATGAA ATTAGAACTT ATAGAACTGA TAGAAATAAT TCAACAACAG ATAGATCAGT TATTCCTTTA TTAGATTTAG TTAATAATTC TAATTCTTAT TACAATCAAA GTTCTAATAG TAAAAATACT TCATATTTAA ACTTTATATT AAATAAAAAA AATTTAACTA GTAAATTTGA TAATAAAACT TTACTAACTG AACTTTTTGA AAATAAAGAC TTTATTGAAC TTTTTACAAC AATTAGTGGT AATAATATTC AGTGAATTTG AGAAAATAAC TGATTGTGAC AACTTGCATT ATATTTTAAT AAGTTTGCTT ATCATTCTTA TGAACAATTT TTAAAAAATA ATAAAGAATA TACTTATTTA AAAAATACTG TAATTGGAAA ATATTTAACT AATAGTTTTA AAGATAAAAA TGAATTTTTA AATGATGCTA AGGTTTTAAA AAATATTAAA ATTAATAATT TAAAAAATAA TTTTAATGCT AAAGATTTTA GAAAAACTTT TAATAAGCAA ATTCAAAATA AAGAATTATT TTCTTATATT TATATAAGTG GAATGTCATT ATTTCAATAT ATTTATAGAA ATATTTATTT ACCATATTTT AGTGATTTTA AAATTGAAAA TAATAAAATA GGTAATAGTT TTTATACTTT TTTAACTGGA AATAAGCTTA ATAATGTTAG 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Protein sequence | MKRIYSFFLL LKQGLKGVFK FKIQFIIILL LSFLASFILS TSLTLTSRIN KTYNNIVNNV NKFDYSSSNE IRTYRTDRNN STTDRSVIPL LDLVNNSNSY YNQSSNSKNT SYLNFILNKK NLTSKFDNKT LLTELFENKD FIELFTTISG NNIQWIWENN WLWQLALYFN KFAYHSYEQF LKNNKEYTYL KNTVIGKYLT NSFKDKNEFL NDAKVLKNIK INNLKNNFNA KDFRKTFNKQ IQNKELFSYI YISGMSLFQY IYRNIYLPYF SDFKIENNKI GNSFYTFLTG NKLNNVSDSQ ADKWVISDKN KSYLTEFELN KTKINQSDNS ILISNQNNKE AIKKLILEKG MKGNTELVLI TSDNQKVQSI NPIINDTSLF KLLFYNGNGT SVTNVVSVLS DTNFIKKDIV IGENQFDNIE LIHNIWLAHL KYTALASGYD INFRTEVFNY DSVTQIRYRL IVLNDDHTTN LTILNKNQGA RLPTKSEALI SEQFARAHKL KLGQQIIVDG ALLSIVGFAT DAYSFFPTTD PDFPIPQSEL GAILYVYKST IKDILSSTSQ SNTNRVSKGY LSFFLTKKHS TASIDMFNAY QMNDISKLYD SIKYQKEQKN KVSTWLNIKD FDHSIFRFNW IIAPLAINTY KISTLIAALA VSLIAIIALI ICIRKTIYFN AKQIGILKAL GSSPLQISIS YLAYILVIIL TSVPLGWIVG LSTQSVFVKL FVHYFSIPLY SFTVEPFSLL ISLLIFGLFG LIISLLTAFL ITKKPLFDIL AVKQNWSSSK FINRLKRTWF KKARFTTKFS LTLASSGKKN IFLLVTVVGI STMFISAGLA IPSIAFTIKN TYYKSIKYAN EYNYAKGVTN SPLTKPTINY WNGQEELDKN ISSTILNNQE LFYYNDPTDY VSSSYDVNPF PKYLYKLEEL NKNNIKETKS KLAWTLLELI QNKDHVNELN KTNSLDLLFT EMFGNNLYNV VGNQFSIGVI DQILGLILNS KDNVINPNDK NTKWTDEQKD LIFKELTNNF TKTGTTAISI LVNDLSTSKS DDWKTKIFDA ILKAVPPYVS AYIQKPSRKE QFSIGYNVQH YIPDHETLTT VSDIKATINQ KNTNLVLTGI SNNQSAFIIN QKNANNLFVD YKKLIALQEV FLEKKSNDIK LNDQFLLYDS KNNQINLPVL PNKQASAFYN LNKTTDISNI LTTSKQFFIN TKNGYVNLPK HAWVYDDLNF IKSKYYNLLT EQQKQLISKF RTGRNSSAVN SDDIRWLDPY NLDNNKFTLK LLYDQDRFDN DSTYDNKEWT LLNNSYMFDD FTYNNQFDDL LSSYIRPYYQ YKNIQIYIPQ SLIDIDQIIN ISNSKKTQDQ LKNNTEHWYK KDIDYNKVPK SVIKAWDIKD SNEKFLMIRP YDLRFTLTID NVYKSGLSNL IAKPEYWMYQ STKTNNSAKL NAQIIQKDAK TVYQNKDLKI VAKPVGTLDS YNQKLILTDQ GLMNLVLNLS IGKKIAIKDN FYNRETVIKA GEKYNDIISR FDRYDFNQIT NYLDKNKNKK EFNNLLFSKK DPFNQAQFLW HNSKYSNIEE ALDLTSGISF IPDTAYNGFY ILNGHGASSA SGDDDMISSI KNQNLLATSK TLINQITFIA ISIGMLLIIT VIITSALLVM LISDIYVTQY QQFMILMKAL GYSNYKISKY AFGTAIVFSL FAWAASTALT WILITLIIKI ITALGFAIPY GFSFWTLIVS FIIITIAFIG SLIVSSNKIR TKKPASLLTV SNE
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