351 genes were found for organism Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mchl_5386  CDS  NC_011758  44  1483  +  1440  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  YP_002424072  normal  1  normal  0.786395  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5387  CDS  NC_011758  1533  1853  -  321  putative sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  YP_002424073  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5388  CDS  NC_011758  1867  3078  -  1212  oxidoreductase molybdopterin binding  YP_002424074  normal  0.359711  normal  0.947595  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5389  CDS  NC_011758  3198  3899  -  702  putative transmembrane anti-sigma factor  YP_002424075  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5390  CDS  NC_011758  3899  4459  -  561  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_002424076  normal  1  normal  0.832628  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5391  CDS  NC_011758  4842  6287  -  1446  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  YP_002424077  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5392  CDS  NC_011758  6628  7110  +  483  hypothetical protein  YP_002424078  normal  0.692914  normal  0.894504  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5393  CDS  NC_011758  7191  8267  +  1077  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_002424079  normal  0.473932  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5394  CDS  NC_011758  8221  9324  +  1104  Radical SAM domain protein  YP_002424080  normal  0.313238  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5395  CDS  NC_011758  9321  9866  +  546  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002424081  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5396  CDS  NC_011758  9866  10861  +  996  AIR synthase related protein  YP_002424082  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5397  CDS  NC_011758  10858  12033  +  1176  glycosyl transferase group 1  YP_002424083  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5398  CDS  NC_011758  12026  12307  +  282  hypothetical protein  YP_002424084  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5399  CDS  NC_011758  12346  13614  +  1269  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_002424085  normal  0.0727587  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5400  CDS  NC_011758  13894  14505  +  612  cobalamin synthesis CobW domain protein  YP_002424086  normal  0.0673913  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5401  CDS  NC_011758  15580  15933  +  354  hypothetical protein  YP_002424087  normal  0.100275  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5402  CDS  NC_011758  16058  16516  +  459  hypothetical protein  YP_002424088  normal  0.129644  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5403  CDS  NC_011758  17416  18255  +  840  Resolvase domain  YP_002424089  normal  0.0521163  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5404  CDS  NC_011758  18620  20836  +  2217  Recombinase  YP_002424090  normal  0.173362  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5405  CDS  NC_011758  20860  22173  -  1314  Chloride channel core  YP_002424091  normal  0.0213924  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5406  CDS  NC_011758  22845  23594  -  750  TIR protein  YP_002424092  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5407  CDS  NC_011758  23597  23758  -  162  hypothetical protein  YP_002424093  normal  0.648449  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5408  CDS  NC_011758  24059  25825  -  1767  hypothetical protein  YP_002424094  normal  0.529754  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5409  CDS  NC_011758  25970  26215  -  246  hypothetical protein  YP_002424095  normal  0.478482  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5410    NC_011758  26595  27034  -  440      normal  0.39005  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5411  CDS  NC_011758  27357  29516  -  2160  protein of unknown function DUF323  YP_002424096  normal  0.750734  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5412  CDS  NC_011758  29628  32981  -  3354  UvrD/REP helicase  YP_002424097  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5413  CDS  NC_011758  32981  35641  -  2661  hypothetical protein  YP_002424098  normal  0.871624  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5414  CDS  NC_011758  35914  38181  -  2268  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_002424099  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5415  CDS  NC_011758  38156  39481  -  1326  hypothetical protein  YP_002424100  normal  0.602565  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5416  CDS  NC_011758  39487  41730  -  2244  hypothetical protein  YP_002424101  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5417  CDS  NC_011758  41684  42637  -  954  hypothetical protein  YP_002424102  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5418  CDS  NC_011758  42687  43184  -  498  hypothetical protein  YP_002424103  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5419  CDS  NC_011758  43297  43812  -  516  hypothetical protein  YP_002424104  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5420  CDS  NC_011758  44996  45385  +  390  hypothetical protein  YP_002424105  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5421  CDS  NC_011758  46428  46925  +  498  hypothetical protein  YP_002424106  normal  0.969816  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5422    NC_011758  47124  47400  -  277      normal  0.802579  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5423    NC_011758  47690  48037  -  348      normal  0.802579  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5424  CDS  NC_011758  48133  48327  -  195  hypothetical protein  YP_002424107  normal  0.698968  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5425  CDS  NC_011758  48328  49563  -  1236  hypothetical protein  YP_002424108  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5426  CDS  NC_011758  49705  49989  +  285  hypothetical protein  YP_002424109  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5427  CDS  NC_011758  49964  50875  -  912  hypothetical protein  YP_002424110  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5428  CDS  NC_011758  51152  52996  -  1845  alpha amylase catalytic region  YP_002424111  normal  0.216663  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5429  CDS  NC_011758  53292  54203  -  912  hypothetical protein  YP_002424112  normal  0.837785  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5430  CDS  NC_011758  54238  55821  -  1584  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  YP_002424113  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5431  CDS  NC_011758  56175  57365  +  1191  hypothetical protein  YP_002424114  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5432  CDS  NC_011758  57362  58309  +  948  hypothetical protein  YP_002424115  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5433  CDS  NC_011758  58625  59275  +  651  hypothetical protein  YP_002424116  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5434  CDS  NC_011758  59646  60887  +  1242  TIR protein  YP_002424117  normal  0.363832  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5435    NC_011758  60945  61334  -  390      normal  0.110732  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5436  CDS  NC_011758  61517  62251  +  735  protein of unknown function DUF1275  YP_002424118  normal  0.176111  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5437  CDS  NC_011758  62546  63961  -  1416  integrase family protein  YP_002424119  normal  0.636069  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5438    NC_011758  64580  64822  -  243      normal  0.900617  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5439  CDS  NC_011758  64860  66080  -  1221  transposase mutator type  YP_002424120  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5440  CDS  NC_011758  66102  66836  -  735  transposase IS111A/IS1328/IS1533  YP_002424121  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5441  CDS  NC_011758  67086  68285  +  1200  transposase mutator type  YP_002424122  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5442    NC_011758  68397  68585  -  189      normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5443    NC_011758  68586  68708  -  123      normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5444  CDS  NC_011758  69469  71268  -  1800  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  YP_002424123  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5445  CDS  NC_011758  71459  72895  +  1437  histidine kinase  YP_002424124  normal  0.403934  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5446  CDS  NC_011758  72892  73548  +  657  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_002424125  normal  0.26634  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5447  CDS  NC_011758  73838  74671  -  834  Integrase catalytic region  YP_002424126  normal  0.681137  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5448  CDS  NC_011758  74749  75639  -  891  Integrase catalytic region  YP_002424127  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5449  CDS  NC_011758  75636  75920  -  285  transposase IS3/IS911 family protein  YP_002424128  normal  0.49737  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5450    NC_011758  76116  76904  -  789      normal  0.564298  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5451  CDS  NC_011758  76970  77950  -  981  Integrase catalytic region  YP_002424129  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5452  CDS  NC_011758  77947  78321  -  375  transposase IS3/IS911 family protein  YP_002424130  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5453  CDS  NC_011758  78681  79760  +  1080  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_002424131  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5454    NC_011758  79777  80061  +  285      normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5455  CDS  NC_011758  80197  81336  -  1140  CBS domain containing membrane protein  YP_002424132  normal  0.547444  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5456  CDS  NC_011758  81523  81843  +  321  hypothetical protein  YP_002424133  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5457  CDS  NC_011758  82319  82855  -  537  2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_002424134  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5458  CDS  NC_011758  82852  83814  -  963  pseudouridine synthase  YP_002424135  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5459  CDS  NC_011758  83825  85087  -  1263  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  YP_002424136  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5460  CDS  NC_011758  85214  86371  -  1158  phosphoserine aminotransferase  YP_002424137  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5461  CDS  NC_011758  86455  87714  -  1260  squalene-associated FAD-dependent desaturase  YP_002424138  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5462  CDS  NC_011758  87722  89158  -  1437  Homospermidine synthase  YP_002424139  normal  1  normal  0.52008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5463  CDS  NC_011758  89257  89706  -  450  GreA/GreB family elongation factor  YP_002424140  normal  1  normal  0.889939  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5464  CDS  NC_011758  90596  91009  +  414  GreA/GreB family elongation factor  YP_002424141  normal  1  normal  0.518516  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5465    NC_011758  91818  92078  -  261      normal  1  normal  0.493895  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5466  CDS  NC_011758  93094  93348  -  255  hypothetical protein  YP_002424142  normal  1  normal  0.374414  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5467  CDS  NC_011758  93602  94045  -  444  GreA/GreB family elongation factor  YP_002424143  normal  1  normal  0.521528  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5468  CDS  NC_011758  94073  94495  -  423  GreA/GreB family elongation factor  YP_002424144  normal  1  normal  0.699388  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5469  CDS  NC_011758  94511  94663  -  153  hypothetical protein  YP_002424145  normal  1  normal  0.867561  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5470  CDS  NC_011758  95293  95532  +  240  hypothetical protein  YP_002424146  normal  1  normal  0.697445  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5471  CDS  NC_011758  96233  96430  +  198  hypothetical protein  YP_002424147  normal  1  normal  0.707727  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5472  CDS  NC_011758  96470  97399  +  930  UspA domain protein  YP_002424148  normal  1  normal  0.814559  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5473  CDS  NC_011758  97460  98110  +  651  hypothetical protein  YP_002424149  normal  1  normal  0.77016  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5474  CDS  NC_011758  98107  98304  +  198  hypothetical protein  YP_002424150  normal  1  normal  0.882848  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5475    NC_011758  98410  98964  +  555      normal  1  normal  0.572625  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5476    NC_011758  98980  99246  +  267      normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5477    NC_011758  99512  99608  +  97      normal  1  normal  0.859955  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5478    NC_011758  99763  100065  -  303      normal  1  normal  0.674394  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5479  CDS  NC_011758  100233  101293  +  1061  Transposase and inactivated derivatives-like protein  YP_002424151  normal  1  normal  0.624312  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5480  CDS  NC_011758  101486  105400  +  3915  hypothetical protein  YP_002424152  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5481    NC_011758  105718  105921  +  204      normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5482    NC_011758  106017  106283  +  267      normal  1  normal  0.688007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5483  CDS  NC_011758  106307  106774  +  468  putative integrase  YP_002424153  normal  1  normal  0.704423  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5484  CDS  NC_011758  106971  107255  +  285  transposase IS3/IS911 family protein  YP_002424154  normal  1  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Mchl_5485  CDS  NC_011758  107252  108142  +  891  Integrase catalytic region  YP_002424155  normal  0.729196  normal  1  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>