23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0236 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0236  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  730    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0236  hypothetical protein  96.56 
 
 
349 aa  705    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0229  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  43.26 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1924  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  41.69 
 
 
352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0939  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  41.69 
 
 
352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1225  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  41.69 
 
 
352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2201  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  41.69 
 
 
352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.929811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1679  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  41.38 
 
 
352 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0228  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  41.38 
 
 
352 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0318  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  41.38 
 
 
352 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2754  pyoverdine biosynthesis  40.19 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35430  pyoverdine biosynthesis protein PvcA  41.46 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000151483  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2987  pyoverdine biosynthesis protein PvcA  41.14 
 
 
328 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1103  Pyoverdine biosynthesis protein  40.06 
 
 
321 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0703  pyoverdine biosynthesis protein  42.27 
 
 
295 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.215316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3225  Pyoverdine biosynthesis protein  39.13 
 
 
321 aa  228  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3133  Pyoverdine biosynthesis protein  44.88 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3777  Pyoverdine biosynthesis protein  41.79 
 
 
274 aa  212  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3131  Pyoverdine biosynthesis protein  31.47 
 
 
587 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02705  conserved hypothetical protein, putative pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein ditA (Eurofung)  30.28 
 
 
664 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.365279 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02606  pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02660)  29.45 
 
 
661 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.195968 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29841  predicted protein  26.81 
 
 
494 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0522184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1537  pvcA protein  23.34 
 
 
608 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>