33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4057 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4057  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  100 
 
 
265 aa  547  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0105  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  98.87 
 
 
265 aa  540  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4074  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  97.36 
 
 
265 aa  500  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.030551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4746  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  56.11 
 
 
265 aa  308  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4067  CDP-diacylglycerol diphosphatase  51.44 
 
 
251 aa  267  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03803  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  51.03 
 
 
251 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03752  hypothetical protein  51.03 
 
 
251 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5373  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  51.03 
 
 
251 aa  264  8.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4452  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  51.03 
 
 
251 aa  264  8.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4358  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  51.03 
 
 
251 aa  264  8.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.619919 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4100  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  51.03 
 
 
251 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.985572  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4149  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  50.21 
 
 
251 aa  258  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4054  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  49.78 
 
 
247 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.230238  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1835  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  41.67 
 
 
250 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.296011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1435  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  42.86 
 
 
252 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.603489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1356  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  45.91 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2621  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  46.4 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5996  CDP-diacylglycerol diphosphatase  39.33 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0231  CDP-diacylglycerol diphosphatase  38.28 
 
 
276 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.198418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0842  CDPdiacylglycerol diphosphatase protein  37.83 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2355  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  39.04 
 
 
259 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.39236  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1010  CDP-diacylglycerol diphosphatase  35.39 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390977  normal  0.0675109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5710  CDP-diacylglycerol diphosphatase  35.4 
 
 
262 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3475  CDP-diacylglycerol diphosphatase  33.88 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0490975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3221  CDP-diacylglycerol diphosphatase  31.44 
 
 
261 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000677051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7480  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  32.74 
 
 
253 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4384  CDP-diacylglycerol diphosphatase  33.63 
 
 
255 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3349  CDP-diacylglycerol diphosphatase  32.48 
 
 
254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427889  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3452  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  30 
 
 
263 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5614  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  29.18 
 
 
256 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4899  CDP-diacylglycerol diphosphatase  30.16 
 
 
252 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4175  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  29.89 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4398  hypothetical protein  40.38 
 
 
103 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>