41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2348 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2444  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  209  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1631  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  209  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2348  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  209  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.668511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2802  hypothetical protein  74.26 
 
 
102 aa  154  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299657 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0792  protein of unknown function DUF437  66.67 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0809  hypothetical protein  66.67 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34364  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4192  hypothetical protein  66.67 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3282  hypothetical protein  64.58 
 
 
103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3207  hypothetical protein  64.58 
 
 
104 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3219  hypothetical protein  63.54 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3285  hypothetical protein  64.58 
 
 
104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3387  hypothetical protein  64.58 
 
 
104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.391337  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02732  hypothetical protein  65.62 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.685634  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3227  hypothetical protein  65.62 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3059  hypothetical protein  65.62 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02695  hypothetical protein  65.62 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.685116  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3321  hypothetical protein  64.58 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3033  hypothetical protein  65.62 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3318  hypothetical protein  62.5 
 
 
118 aa  122  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1922  hypothetical protein  52.53 
 
 
104 aa  107  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1625  hypothetical protein  51.52 
 
 
103 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1701  hypothetical protein  50.51 
 
 
110 aa  103  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2278  hypothetical protein  51.04 
 
 
103 aa  102  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445421  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1763  hypothetical protein  48.42 
 
 
105 aa  102  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0816952  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1560  hypothetical protein  52.58 
 
 
104 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2524  hypothetical protein  51.04 
 
 
105 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2517  hypothetical protein  51.04 
 
 
105 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.955293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2637  hypothetical protein  51.04 
 
 
105 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1700  hypothetical protein  48.48 
 
 
103 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1827  hypothetical protein  51.04 
 
 
105 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.437547 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1494  hypothetical protein  53.12 
 
 
107 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2692  hypothetical protein  51.04 
 
 
109 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1651  hypothetical protein  45.83 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.865304  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1824  hypothetical protein  44.9 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05196  hypothetical protein  44.21 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001315  hypothetical protein  42.11 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1180  hypothetical protein  40.62 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.445201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0075  hypothetical protein  37.5 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3436  hypothetical protein  36.46 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.345221  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0595  hypothetical protein  39.58 
 
 
109 aa  70.1  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1652  hypothetical protein  37.11 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>