19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3857 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3767  phage shock protein G  100 
 
 		 72 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00116366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1303  phage shock protein G  100 
 
 		 72 aa  133  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3857  phage shock protein G  100 
 
 		 72 aa  133  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.276106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4452  phage shock protein G  76.39 
 
 		 72 aa  106  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.32573  normal  0.677763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3632  phage shock protein G  63.01 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3496  phage shock protein G  63.01 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.399736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0712  phage shock protein G  64.29 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.230233  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0254  phage shock protein G  62.5 
 
 		 80 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.513953  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3943  phage shock protein G  58.33 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03882  hypothetical protein  58.33 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5552  phage shock protein G  58.33 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3978  phage shock protein G  58.33 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.212783 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03922  phage shock protein G  58.33 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.859868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4602  phage shock protein G  58.33 
 
 		 80 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4545  phage shock protein G  55.56 
 
 		 80 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4511  phage shock protein G  58.46 
 
 		 74 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0743  phage shock protein G  58.33 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002347  hypothetical protein  39.68 
 
 		 71 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00008  phage shock protein G  39.68 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>