19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00008 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00008  phage shock protein G  100 
 
 
71 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002347  hypothetical protein  94.37 
 
 
71 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4452  phage shock protein G  42.25 
 
 
72 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.32573  normal  0.677763 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3943  phage shock protein G  39.73 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03882  hypothetical protein  39.73 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5552  phage shock protein G  39.73 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3978  phage shock protein G  39.73 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.212783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4602  phage shock protein G  39.73 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03922  phage shock protein G  39.73 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.859868  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0712  phage shock protein G  36.76 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.230233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2791  phage shock protein G  61.9 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.509607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3496  phage shock protein G  33.8 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.399736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3632  phage shock protein G  33.8 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4545  phage shock protein G  36.99 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0254  phage shock protein G  32.91 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.513953  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4511  phage shock protein G  37.5 
 
 
74 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1303  phage shock protein G  39.68 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3857  phage shock protein G  39.68 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.276106  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3767  phage shock protein G  39.68 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00116366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>