27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1953 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1953  putative virulence factor SrfB  100 
 
 		 383 aa  793    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2281  SrfB superfamily virulence factor  99.72 
 
 		 987 aa  734    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1843  putative virulence factor SrfB  100 
 
 		 1023 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2382  virulence protein SrfB  75.07 
 
 		 995 aa  550  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2094  virulence protein SrfB  75.07 
 
 		 995 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.125719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1881  virulence protein SrfB  68.35 
 
 		 995 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0611287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2101  virulence protein SrfB  69.92 
 
 		 996 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1434  virulence protein SrfB  62.81 
 
 		 981 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2109  virulence protein SrfB  57.33 
 
 		 993 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1709  virulence protein SrfB  59.66 
 
 		 993 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1774  virulence protein SrfB  59.38 
 
 		 993 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.513722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1712  virulence protein SrfB  59.1 
 
 		 993 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1566  virulence protein SrfB  59.38 
 
 		 993 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.823683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1747  virulence protein SrfB  59.38 
 
 		 993 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.841748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0470  virulence protein SrfB  51.55 
 
 		 1000 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4239  virulence protein SrfB  51.82 
 
 		 1000 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52090  hypothetical protein  51.68 
 
 		 992 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1845  hypothetical protein  46.3 
 
 		 996 aa  325  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2871  hypothetical protein  41.82 
 
 		 1044 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2632  virulence protein SrfB  41.3 
 
 		 1044 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.623195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3154  hypothetical protein  34.02 
 
 		 993 aa  212  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.30642  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4052  hypothetical protein  33.75 
 
 		 1020 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0348037  normal  0.215609 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1313  virulence factor SrfB-like protein  33.6 
 
 		 1036 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0897  virulence protein SrfB  32.47 
 
 		 1041 aa  179  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.112933  normal  0.362744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1964  virulence protein SrfB  32.03 
 
 		 1042 aa  175  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3216  virulence factor SrfB-like protein  33.51 
 
 		 996 aa  166  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.952482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6482  virulence protein SrfB  27.51 
 
 		 1048 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>