18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1660 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1660  osmoregulated periplasmic glucan biosynthetic protein  100 
 
 		 127 aa  253  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1869  glucans biosynthesis protein  53.08 
 
 		 376 aa  131  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.816656 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2598  acyltransferase 3  42.06 
 
 		 385 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01051  hypothetical protein  42.06 
 
 		 385 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.324089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1427  glucans biosynthesis protein  42.06 
 
 		 385 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0273757  normal  0.379852 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2552  glucans biosynthesis protein  42.06 
 
 		 385 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170085  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1167  glucans biosynthesis protein  42.06 
 
 		 385 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193377  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1168  glucans biosynthesis protein  42.06 
 
 		 385 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0460128  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01044  glucans biosynthesis protein  42.06 
 
 		 385 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2084  glucans biosynthesis protein  42.06 
 
 		 385 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.72315  normal  0.86966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1245  glucans biosynthesis protein  47.57 
 
 		 384 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2284  glucans biosynthesis protein  41.27 
 
 		 385 aa  94.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624965  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1260  glucans biosynthesis protein  47.57 
 
 		 384 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1216  glucans biosynthesis protein  47.57 
 
 		 384 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.844571  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2040  glucans biosynthesis protein  47.57 
 
 		 384 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000145807  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2224  glucans biosynthesis protein  47.57 
 
 		 384 aa  93.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1563  glucans biosynthesis protein  44.12 
 
 		 385 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0264724  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1822  hypothetical protein  32.41 
 
 		 376 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.399568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>