33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0105 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0105  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4057  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  98.87 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4074  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  97.74 
 
 		 265 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.030551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4746  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  55.73 
 
 		 265 aa  308  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4067  CDP-diacylglycerol diphosphatase  51.03 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03803  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  50.62 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03752  hypothetical protein  50.62 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5373  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  50.62 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4452  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  50.62 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4358  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  50.62 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619919 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4100  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  50.62 
 
 		 251 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.985572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4149  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  49.79 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4054  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  49.33 
 
 		 247 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.230238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1835  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  41.25 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.296011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1435  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  42.41 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.603489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1356  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  46.36 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2621  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  46.4 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5996  CDP-diacylglycerol diphosphatase  38.95 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0231  CDP-diacylglycerol diphosphatase  37.5 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.198418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0842  CDPdiacylglycerol diphosphatase protein  37.55 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1010  CDP-diacylglycerol diphosphatase  35.95 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390977  normal  0.0675109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2355  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  39.47 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.39236  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5710  CDP-diacylglycerol diphosphatase  35.84 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3475  CDP-diacylglycerol diphosphatase  34.02 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0490975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3221  CDP-diacylglycerol diphosphatase  31.06 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000677051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7480  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  31.86 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4384  CDP-diacylglycerol diphosphatase  33.48 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3349  CDP-diacylglycerol diphosphatase  32.34 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3452  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  30.68 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5614  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  28.4 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4899  CDP-diacylglycerol diphosphatase  29.64 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4175  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  29.31 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4398  hypothetical protein  40.38 
 
 		 103 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>