46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1377 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  97.52 
 
 		 202 aa  397  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01875  lipoprotein  70.75 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  56.82 
 
 		 194 aa  184  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  28.4 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  29.14 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  29.82 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  29.82 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  29.82 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  29.24 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  29.07 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  25.13 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  26.82 
 
 		 164 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  26.55 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.52 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.52 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  26.74 
 
 		 164 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  27.49 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  27.49 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  23.43 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  26.22 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  27.49 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  27.49 
 
 		 164 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  28.66 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  23.64 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  23.95 
 
 		 175 aa  48.5  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  24.86 
 
 		 164 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  24.86 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.33 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.33 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.33 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  25.47 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  25.16 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1190  rare lipoprotein B  23.65 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  25.3 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  30 
 
 		 176 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  27.38 
 
 		 164 aa  45.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  21.69 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  21.84 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  23.9 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  29.76 
 
 		 183 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  22.98 
 
 		 173 aa  42  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  25.79 
 
 		 169 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  29.76 
 
 		 183 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  28.33 
 
 		 170 aa  41.6  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1072  rare lipoprotein B  25.3 
 
 		 167 aa  41.6  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>