11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_R0056 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_R0056    98.86 
 
 		 352 bp  666    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0056    100 
 
 		 354 bp  702    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.517652  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0052    94.34 
 
 		 392 bp  81.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0051    96.77 
 
 		 348 bp  54  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0119    90.24 
 
 		 355 bp  50.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0119    90.24 
 
 		 355 bp  50.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0116    90.24 
 
 		 355 bp  50.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.798208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0016    90.24 
 
 		 354 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0033    93.55 
 
 		 355 bp  46.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55180  10Sa RNA SsrA (tmRNA)  89.74 
 
 		 352 bp  46.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0033    89.74 
 
 		 360 bp  46.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  hitchhiker  0.000000433603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>